文献

J-GLOBAL ID：201102202157673612   整理番号：11A1096763

mtDNA及びElimaea cheni(Tettigoniidae: Phaneropterinae)ミトゲノムの記載から推定した直翅類の系統発生

The phylogeny of Orthoptera inferred from mtDNA and description of Elimaea cheni (Tettigoniidae: Phaneropterinae) mitogenome

著者 (4件)： Zhou Zhijun (Coll. of Life Sci., Hebei Univ., Baoding) ,  Ye Haiyan (Coll. of Life Sci., Shaanxi Normal Univ., Xi’an) ,  Huang Yuan (Coll. of Life Sci., Shaanxi Normal Univ., Xi’an) ,  Shi Fuming (Coll. of Life Sci., Hebei Univ., Baoding)
資料名： Journal of Genetics and Genomics  (Journal of Genetics and Genomics)
巻： 37  号： 5  ページ： 315-324  発行年： 2010年 
JST資料番号： C2547A  ISSN： 1673-8527  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Elimaea cheni(Phaneropterinae)のミトコンドリアゲノムの完全15831ヌクレオチド配列を決定した。coxlの推定開始コドンはTTAであった。異なるmtDNAデータセットに基づく直翅類の系統発生を最大可能性(ML)及びBayesian推論(BI)により解析した。全37遺伝子(mtDNA)を同時に解析し,Caelifera及びEnsiferaの単系性を分類サンプリングの状況において回収した。直翅類の系統発生は先の系統発生仮説とほとんど一致した。Tettigoniidaeの姉妹群であるRhaphidophoridae及びTettigoniidaeの4サブファミリー間の関連性は(Phaneropterinae+(Conocephalinae+(Bradyporinae+Tettigoniinae))であった。PyrgomorphidaeはCaelifera最も基幹的グループであった。6つのacrididサブファミリー間の関係は(Oedipodinae+(Acridinae+(Gomphocerinae+(Oxyinae+(Calliptaminae+Cyrtacanthacridinae)))))であった。しかしながら,単系Grylloideaを回収しなかった。MyrmecophilidaeはGryllidaeの代わりにGryllotalpidaeを含むクレードにクラスター化した。全蛋白質コード遺伝子(ヌクレオチド配列データまたは第三コドン位置を除外及びアミノ酸配列を用いて)のML及びBI解析により,全mtDNAゲノムデータセットのそれに一致するトポロジーを明らかにした。しかしながら,単独データセットとして解析した時,DHUループ及びTψCループ(TRNA)を除く22tRNA遺伝子及び2つのrRNA遺伝子(RRNA)は正常に機能しなかった。これらの結果から,最良の系統発生推定は総mtDNAに基づくML及びBI法であった。tRNAを除いて,データセットの蛋白質コード遺伝子及びヌクレオチド配列をアミノ酸配列に変換するrRNA遺伝子及び第三コドン位は系統発生再構築にポジティブに影響しなかった。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST

シソーラス用語： *直翅類 ,  DNA【核酸】 ,  *系統発生 ,  ヌクレオチド配列 ,  *ケモタキソノミー ,  アミノ酸配列 ,  位相幾何学 ,  rRNA ,  種差 ,  相同性 ,  Bayes推定
準シソーラス用語： mtDNA ,  *Elimaea cheni

分類 (1件)： 動物分類学  (EJ01030T)

タイトルに関連する用語 (5件)： mtDNA ,  ゲノム ,  推定 ,  直翅類 ,  系統発生