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J-GLOBAL ID：201102202456942018   整理番号：11A0167208

未配列決定オオムギゲノムでの候補多型分離のためのゲノムワイド関連マッピング

Genome-wide association mapping to candidate polymorphism resolution in the unsequenced barley genome

著者 (23件)： COCKRAM James (National Inst. Agricultural Botany(NIAB), Cambridge, GBR) ,  WHITE Jon (National Inst. Agricultural Botany(NIAB), Cambridge, GBR) ,  ZULUAGA Diana L. (National Inst. Agricultural Botany(NIAB), Cambridge, GBR) ,  SMITH David (National Inst. Agricultural Botany(NIAB), Cambridge, GBR) ,  COMADRAN Jordi (Scottish Crop Res. Inst., Dundee, GBR) ,  MACAULAY Malcolm (Scottish Crop Res. Inst., Dundee, GBR) ,  LUO Zewei (Univ. Birmingham, Birmingham, GBR) ,  KEARSEY Mike J. (Univ. Birmingham, Birmingham, GBR) ,  WERNER Peter (KWS UK Ltd., Royston, GBR) ,  HARRAP David (KWS UK Ltd., Royston, GBR) ,  TAPSELL Chris (KWS UK Ltd., Royston, GBR) ,  LIU Hui (Scottish Crop Res. Inst., Dundee, GBR) ,  HEDLEY Peter E. (Scottish Crop Res. Inst., Dundee, GBR) ,  STEIN Nils (Leibniz Inst. Plant Genetics and Crop Plant Res.(IPK), Gatersleben, DEU) ,  SCHULTE Daniela (Leibniz Inst. Plant Genetics and Crop Plant Res.(IPK), Gatersleben, DEU) ,  STEUERNAGEL Burkhard (Leibniz Inst. Plant Genetics and Crop Plant Res.(IPK), Gatersleben, DEU) ,  MARSHALL David F. (Scottish Crop Res. Inst., Dundee, GBR) ,  THOMAS William T.B. (Scottish Crop Res. Inst., Dundee, GBR) ,  RAMSAY Luke (Scottish Crop Res. Inst., Dundee, GBR) ,  MACKAY Ian (National Inst. Agricultural Botany(NIAB), Cambridge, GBR) ,  BALDING David J. (Univ. Coll. London, London, GBR) ,  WAUGH Robbie (Scottish Crop Res. Inst., Dundee, GBR) ,  O’SULLIVAN Donal M. (National Inst. Agricultural Botany(NIAB), Cambridge, GBR)
資料名： Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  (Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America)
巻： 107  号： 50  ページ： 21611-21616  発行年： 2010年12月14日 
JST資料番号： D0387A  ISSN： 0027-8424  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 同系交配オオムギでの32の表現型を用いて,15の形態形質のゲノムワイド関連(GWA)マッピングを行った。ヒトGWA検討と異なり,染色体内および間で高レベルの連鎖不均衡が見られた。GWAマッピングと比較分析を組み合わせ,未配列決定ゲノムで形質を候補多型レベルに分離できるかを検討した。3つの遺伝子を含む140kb間隔内の1つの表現型(アントシアニン色素沈着)を選択し,さらに詳細にマッピングした。これらのうち,推定アントシアニン経路遺伝子HvbHLH1の再シーケンシングで,未成熟終止コドンを生じる欠失を同定した。このコドンは,基本的なヘリックス-ループ-ヘリックスドメインの上流にあり,本報での関連および二親性マッピング集団において,非機能性対立遺伝子と完全に相関した。

シソーラス用語： オオムギ ,  表現型 ,  アントシアニン ,  *遺伝学実験技術 ,  遺伝子 ,  対立遺伝子 ,  *解析 ,  ヌクレオチド配列 ,  遺伝子多型 ,  *ゲノムワイド関連解析
準シソーラス用語： *遺伝子マッピング ,  HvbHLH1遺伝子 ,  遺伝子マーカ ,  *GWAS ,  ant2遺伝子

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (4件)： オオムギ ,  ゲノム ,  多型 ,  マッピング