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J-GLOBAL ID：201102203506904143   整理番号：11A1419672

ABEEMσπ/MM法によるヒトプラスミノーゲンおよびその配位子の組換え型クリングル1ドメインの複合体の計算

Calculation of Complexes of the Recombinant Kringle 1 Domain of Human Plasminogen and Its Ligands by ABEEM σπ/MM Method

著者 (3件)： Zhang Wenlong (School of Chemistry and Chemical Engineering, Liaoning Normal Univ., Dalian) ,  Chen Shuling (School of Chemistry and Chemical Engineering, Liaoning Normal Univ., Dalian) ,  Yang Zhongzhi (School of Chemistry and Chemical Engineering, Liaoning Normal Univ., Dalian)
資料名： Gaodeng Xuexiao Huaxue Xuebao  (Gaodeng Xuexiao Huaxue Xuebao)
巻： 31  号： 8  ページ： 1630-1635  発行年： 2010年 
JST資料番号： C2116A  ISSN： 0251-0790  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： ABEEMσπ/MM法によってヒトプラスミノーゲンの組換え型クリングル1ドメインと5つの配位子[ε-アミノカプロン酸(EACA),trans-4-(アミノメチル)シクロヘキサン-1-カルボン酸(AMCHA),L-リシン(Lys),7-アミノヘプタン酸(7-AHA)およびベンジルアミン]の間の相互作用を理解するために,セミフレキシブルドッキング研究を行った。結果は,シミュレーション構造が結晶構造に非常に近いことを示す。5つの複合体の計算結合エネルギーは,AMCHA>EACA>7-AHA>Lys>ベンジルアミンの順で,実験からの平衡会合定数(K_a)の価と一致する。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST

シソーラス用語： ヒト ,  シミュレーション ,  *プラスミノーゲン ,  配位子 ,  分子内力学 ,  結合部位 ,  相互作用 ,  *計算機シミュレーション ,  複合体 ,  アミノ酸 ,  脂肪族アミン ,  脂肪族カルボン酸 ,  第一アミン ,  カルボン酸 ,  脂環式化合物 ,  芳香族化合物
準シソーラス用語： MM法 ,  クリングルドメイン ,  *ドッキングシミュレーション

分類 (2件)： 酵素一般  (EB09010D) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

物質索引 (5件)： 7-アミノヘプタン酸 ,  L-リシン ,  trans-4-アミノメチルシクロヘキサン-1-カルボン酸 ,  ε-アミノカプロン酸 ,  ベンジルアミン

タイトルに関連する用語 (7件)： MM法 ,  配位子 ,  組換え型 ,  クリングル ,  ドメイン ,  複合体 ,  計算