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J-GLOBAL ID：201102206500252470   整理番号：11A0294092

蛋白質-蛋白質界面の構造空間は縮重し,完成に近く,高度に結合している

Structural space of protein-protein interfaces is degenerate, close to complete, and highly connected

著者 (2件)： GAO Mu (Georgia Inst. Technol., GA) ,  SKOLNICK Jeffrey (Georgia Inst. Technol., GA)
資料名： Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  (Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America)
巻： 107  号： 52  ページ： 22517-22522  発行年： 2010年12月28日 
JST資料番号： D0387A  ISSN： 0027-8424  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 二量体間の相互作用を含む蛋白質-蛋白質界面の構造類似性について解析した。二量体を形成する個々の単量体間に構造類似性がなくても,界面の90%は類似するバックボーンCα幾何学,界面結合様式を持つ密接な構造同胞を有していた。界面の80%は密度の高いネットワークを形成し,いずれの2つの界面も構造的に関連した。界面空間の縮重性はコンパクトな水素結合二次構造エレメントのパッキングに起因し,その結果幾何学的に高度に縮重した平らな相互作用表面が生み出された。蛋白質界面ライブラリーは完成に近づいていて,約1000の界面型より構成されることを示唆した。

シソーラス用語： *二量体 ,  *タンパク質複合体 ,  単量体 ,  界面 ,  表面構造 ,  水素結合 ,  二次構造 ,  ペプチドライブラリー ,  分子間相互作用 ,  ヒストン ,  シャペロンタンパク質
準シソーラス用語： 蛋白質相互作用 ,  ヒストンH3 ,  Asf1蛋白質

分類 (1件)： 分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (3件)： 蛋白質 ,  界面 ,  縮重