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J-GLOBAL ID：201102213574966462   整理番号：11A0519793

ウシ瘤胃からのバイオマス分解遺伝子およびゲノムのメタゲノム的発見

Metagenomic Discovery of Biomass-Degrading Genes and Genomes from Cow Rumen

著者 (28件)： HESS Matthias (Joint Genome Inst., CA, USA) ,  HESS Matthias (Lawrence Berkeley National Lab., CA, USA) ,  SCZYRBA Alexander (Joint Genome Inst., CA, USA) ,  SCZYRBA Alexander (Lawrence Berkeley National Lab., CA, USA) ,  EGAN Rob (Joint Genome Inst., CA, USA) ,  EGAN Rob (Lawrence Berkeley National Lab., CA, USA) ,  KIM Tae-Wan (Univ. California, CA, USA) ,  CHOKHAWALA Harshal (Univ. California, CA, USA) ,  SCHROTH Gary (Illumina Inc., CA, USA) ,  LUO Shujun (Illumina Inc., CA, USA) ,  CLARK Douglas S. (Univ. California, CA, USA) ,  CHEN Feng (Joint Genome Inst., CA, USA) ,  CHEN Feng (Lawrence Berkeley National Lab., CA, USA) ,  ZHANG Tao (Joint Genome Inst., CA, USA) ,  ZHANG Tao (Lawrence Berkeley National Lab., CA, USA) ,  MACKIE Roderick I. (Univ. Illinois, IL, USA) ,  PENNACCHIO Len A. (Joint Genome Inst., CA, USA) ,  PENNACCHIO Len A. (Lawrence Berkeley National Lab., CA, USA) ,  TRINGE Susannah G. (Joint Genome Inst., CA, USA) ,  TRINGE Susannah G. (Lawrence Berkeley National Lab., CA, USA) ,  VISEL Axel (Joint Genome Inst., CA, USA) ,  VISEL Axel (Lawrence Berkeley National Lab., CA, USA) ,  WOYKE Tanja (Joint Genome Inst., CA, USA) ,  WOYKE Tanja (Lawrence Berkeley National Lab., CA, USA) ,  WANG Zhong (Joint Genome Inst., CA, USA) ,  WANG Zhong (Lawrence Berkeley National Lab., CA, USA) ,  RUBIN Edward M. (Joint Genome Inst., CA, USA) ,  RUBIN Edward M. (Lawrence Berkeley National Lab., CA, USA)
資料名： Science  (Science)
巻： 331  号： 6016  ページ： 463-467  発行年： 2011年01月28日 
JST資料番号： E0078A  ISSN： 0036-8075  CODEN： SCIEA  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 化石燃料に代わるバイオ燃料の資源としてリグノセルロース系植物が注目されているが,これを処理できる消化酵素遺伝子をメタゲノム的に高効率でスクリーニングする手法がなく,目的のバイオ燃料を工業的に生産する上での障害となっている。本報告では,ウシの瘤胃に外科手術的に取り付けた容器中でリグノセルロース系植物を培養後,残留植物繊維に付着した微生物から,ウシ胃内微生物の268ギガベースに及ぶメタゲノミックDNA配列データベースを用いてバイオマス分解遺伝子をスクリーニングした。その結果,少なくともひとつの活性部位か炭水化物結合部位を有する27755個の炭水化物活性酵素候補遺伝子を見出した。そのうち90遺伝子を選択し,遺伝子発現系を用いて10種基質に対する生化学的活性を測定したところ,少なくともひとつの基質に酵素活性を示す51遺伝子(57%)が得られた。また,培養せずに植物繊維にゆるく付着した微生物15種類に対する単一細胞からのゲノム配列解析を行い,利用したドラフトゲノム配列の有効性を確認した。以上,本方法により得られたデータセットにより,より多くのリグノセルロース系植物分解酵素をカタログ化できた。

シソーラス用語： バイオマス ,  遺伝学 ,  *生物燃料 ,  ウシ ,  微生物分解 ,  ゲノム ,  基質 ,  瘤胃 ,  リグノセルロース ,  *瘤胃微生物 ,  スクリーニング ,  微生物タンパク質 ,  酵素活性度 ,  セルロース分解 ,  メタゲノム ,  メタゲノミクス ,  自然科学 ,  家畜
準シソーラス用語： バイオ燃料 ,  メタゲノム解析

分類 (2件)： 生物燃料及び廃棄物燃料  (LB02020Y) ,  微生物の生態  (EG03040J)

タイトルに関連する用語 (8件)： ウシ ,  瘤胃 ,  バイオマス ,  分解 ,  遺伝子 ,  ゲノム ,  メタゲノム ,  発見