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J-GLOBAL ID：201102213952551136   整理番号：11A0930202

ウイルスDNAと複合したHIV-1インテグラーゼダイマーの分子動力学シミュレーション

Molecular Dynamics Simulation of HIV-1 Integrase Dimer Complexed with Viral DNA

著者 (2件)： Hu,Jianping (Dep. of Chemistry and Life Sci., Leshan Teachers Coll., Sichuan, Leshan) ,  Wang,Cunxin (Coll. of Life Sci. and Bioengineering, Beijing Univ. of Technol., Beijing)
資料名： Chinese Journal of Chemistry  (Chinese Journal of Chemistry)
巻： 28  号： 1  ページ： 33-40  発行年： 2010年 
JST資料番号： W0337A  ISSN： 1001-604X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： HIV-1インテグラーゼ(IN)の生物学的性能は,ウイルスDNAをホスト細胞染色体と統合する事であり,そしてINのウイルスDNAとの特異結合は,INが正しく機能する為の予備条件である。前以ってINダイマー(IN_2)を,ウイルスDNAの27bpセグメントと,3’プロセス(3’-P)の前に分子ドッキング法経由で得た。結合モードに基づく本報告の目的は,動力学的相互相関地図(DCCM)と基本成分分析(PCA)を通して,その結合後に,モチーフモードの変化と,1N2とDNAシステムに対する相関物の動作を探ることであった。最終的に,相関の間の溶媒効果を簡潔に分析した。結果は,IN_2とウイルスDNAの間の界面領域に,著しく増強された正の相関がある事を示している。また,2個のシステム(IN_2とDNA)のいくつかの明白なモチーフモードの変化が,その結合後に観測された。IN_2とウイルスDNAの間の識別をする上で,水媒介性水素結合を分析する事を通して,水分子が重要な役割を果たしている事がわかった。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST

シソーラス用語： DNA【核酸】 ,  HIV1 ,  インテグラーゼ ,  *二量体 ,  計算機シミュレーション ,  生物学 ,  水素結合
準シソーラス用語： ウイルスDNA ,  *ダイマー ,  分子動力学シミュレーション

分類 (1件)： 化学一般その他  (CA01060X)

タイトルに関連する用語 (3件)： ウイルスDNA ,  HIV-1 ,  分子動力学シミュレーション