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J-GLOBAL ID：201102219126257904   整理番号：11A1296420

疾患の進行に関わるアノテーションされていない長い遺伝子間非コードRNA PCAT-1が前立腺がんコホートのトランスクリプトーム配列解読で明らかにされる

Transcriptome sequencing across a prostate cancer cohort identifies PCAT-1, an unannotated lincRNA implicated in disease progression

著者 (20件)： PRENSNER John R (Univ. Michigan Medical School, Michigan, USA) ,  IYER Matthew K (Univ. Michigan Medical School, Michigan, USA) ,  BALBIN O Alejandro (Univ. Michigan Medical School, Michigan, USA) ,  DHANASEKARAN Saravana M (Univ. Michigan Medical School, Michigan, USA) ,  CAO Qi (Univ. Michigan Medical School, Michigan, USA) ,  BRENNER J Chad (Univ. Michigan Medical School, Michigan, USA) ,  ASANGANI Irfan A (Univ. Michigan Medical School, Michigan, USA) ,  GRASSO Catherine S (Univ. Michigan Medical School, Michigan, USA) ,  KOMINSKY Hal D (Univ. Michigan Medical School, Michigan, USA) ,  CAO Xuhong (Univ. Michigan Medical School, Michigan, USA) ,  JING Xiaojun (Univ. Michigan Medical School, Michigan, USA) ,  WANG Xiaoju (Univ. Michigan Medical School, Michigan, USA) ,  SIDDIQUI Javed (Univ. Michigan Medical School, Michigan, USA) ,  ROBINSON Daniel (Univ. Michigan Medical School, Michigan, USA) ,  PALANISAMY Nallasivam (Univ. Michigan Medical School, Michigan, USA) ,  MAHER Christopher A (Univ. Michigan Medical School, Michigan, USA) ,  CHINNAIYAN Arul M (Univ. Michigan Medical School, Michigan, USA) ,  LAXMAN Bharathi (Univ. Chicago, Illinois, USA) ,  WEI John T (Univ. Michigan Medical School, Michigan, USA) ,  IYER Hari K (Colorado State Univ., Colorado, USA)
資料名： Nature Biotechnology  (Nature Biotechnology)
巻： 29  号： 8  ページ： 742-749  発行年： 2011年08月 
JST資料番号： H0870A  ISSN： 1087-0156  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 非コードRNA(ncRNA)は,疾患の新規マーカーとなったり,腫瘍生物学の未知の部分を明らかにしたりする可能性があり,ヒトのがんにとって重要な分子となってきている。我々は,102点の前立腺組織および細胞株に由来するpolyA⁺RNAの高処理能配列解読(RNA-Seq)のリードを最初から組み立てることにより,アノテーションされていない前立腺がん関連ncRNA転写物(PCAT)121個を発見した。PCAT-1というncRNAは前立腺特異的な細胞増殖調節因子であることが明らかにされ,これがポリコーム抑制複合体2(PRC2)の標的であることがわかった。さらに,PCAT-1およびPRC2の発現パターンは,PCAT-1が抑制する標的遺伝子の発現特性で区別される分子サブタイプに患者の組織を層別することが発見された。こうしたことから,PCAT-1は一部の前立腺がん患者に関係する転写抑制因子であることが示唆される。今回の発見は,がんのサブタイプの層別を改良する可能性のある疾患関連ncRNAの同定にRNA-Seqが有用であることを示している。Copyright Nature Publishing Group 2011

シソーラス用語： *ヌクレオチド配列 ,  *RNA【核酸】 ,  *トランスクリプトーム ,  *前立腺腫瘍 ,  *タンパク質複合体 ,  細胞増殖 ,  転写因子 ,  レプレッサー ,  ヒト
準シソーラス用語： *PCAT-1 ,  *ポリコーム抑制複合体2 ,  細胞増殖調節因子 ,  前立腺癌 ,  転写抑制因子 ,  *非コードRNA

分類 (3件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  泌尿生殖器の腫よう  (GM04000S) ,  腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N)

タイトルに関連する用語 (7件)： 疾患 ,  アノテーション ,  非コードRNA ,  前立腺がん ,  コホート ,  トランスクリプトーム ,  解読