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J-GLOBAL ID：201102219408960870   整理番号：11A1405052

2009年に手足口病の重慶小児から分離されたエンテロウイルス属71型の同定とそのゲノム特性

Identification of enterovirus type 71 isolated from Chongqing children with hand-foot-mouth disease in 2009 and its genomic characteristics

著者 (4件)： Cai Lijun (Dep. of Infection and Gastroenterology, Children’s Hospital, Chongqing Medical Univ., Chongqing) ,  Wang Jun (Dep. of Infection and Gastroenterology, Children’s Hospital, Chongqing Medical Univ., Chongqing) ,  Xu Hongmei (Dep. of Infection and Gastroenterology, Children’s Hospital, Chongqing Medical Univ., Chongqing) ,  Chang Guohui (State Key Lab. of Pathogens and Biosecurity, Inst. of Microbiology and Epidemiology, Acad. of Military Medical ...)
資料名： Disan Junyi Daxue Xuebao  (Disan Junyi Daxue Xuebao)
巻： 32  号： 15  ページ： 1589-1593  発行年： 2010年 
JST資料番号： C2217A  ISSN： 1000-5404  CODEN： DYXUE8  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 【目的】2009年の重慶からの手足口病(HFMD)患者の糞から分離されたエンテロウイルス属71型(EV_(71))のゲノムシーケンス特徴と可能な起源を検討して,類似のゲノム配列の3つのEV_(71)株の進化を比較する。【方法】HFMD標本を,エンテロウイルス属(EV)の分離のためにヒト横紋筋肉腫(RD)細胞に接種した。病気にかかった細胞の上澄みを,EV,EV_(71)とCoxsackie A16の特異的プライマーでのRT-PCRによって,それぞれ検出した。ウイルス粒子の形態を電子顕微鏡の下で観察した。特定されたウイルス遺伝子を4つの断片に切って,RT-PCRによって増幅した。完全なゲノム配列をPCRによって検出して,生物情報科学プログラムを使用して分析して,進化論木にプロットした。【結果】重い病気にかかった細胞が,EVを分離するためにRD細胞に接種されたHFMDの患者からの47の標本の内の7つで観察された。RT-PCRは,7つの標本中の3つはEVとEV_(71)の特異的プライマーが陽性であることを示して,すべての検体がCoxsackie A16の特異的プライマーが陰性だった。EV_(71)は,その特異的プライマーのPCR生成物の塩基配列決定によってEV_(71)ウイルスであることが確認された。感染したRD細胞のウイルス粒子は,走査電子顕微鏡の下で包膜なしで形状は丸かった。3つのEV_(71)株の長さは,それぞれ7409nt,7406ntと7404ntであった。それらの相同性VP1シーケンスは99%以上に達した。送風分析は,重慶で分離された株(Chongqing2-09-中国およびChongqing3-09-中国)の相同性はFuyang,安徽省(2008),中国で分離された株のそれと類似であることを示した。Chongqing1-09-中国の相同性は,台湾(2005,中国)で分離された984ポリ蛋白質と1235ポリ蛋白質のそれと同一だった。Phyiogenefie分析法は,これらの株がC4遺伝子のサブタイプに属していることを示した。・・・Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST

シソーラス用語： *エンテロウイルス ,  手足口病 ,  ゲノム ,  子供 ,  中国西南部 ,  ヌクレオチド配列 ,  走査電子顕微鏡 ,  ウイルス遺伝子 ,  ビリオン ,  RT-PCR法
準シソーラス用語： RT-PCR ,  ウイルス粒子 ,  *エンテロウイルス属 ,  ゲノムシークエンス ,  重慶 ,  小児

分類 (2件)： 神経の基礎医学  (GN01020W) ,  細胞生理一般  (EF02010S)

タイトルに関連する用語 (6件)： 手足口病 ,  重慶 ,  小児 ,  エンテロウイルス属 ,  同定 ,  ゲノム