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J-GLOBAL ID：201102232472852718   整理番号：11A1037143

海洋性糸状シアノバクテリアLyngbya majusculaの生理学および生態学へのゲノム洞察

Genomic insights into the physiology and ecology of the marine filamentous cyanobacterium Lyngbya majuscula

著者 (18件)： JONES Adam C. (Univ. California at San Diego, CA) ,  MONROE Emily A. (Univ. California at San Diego, CA) ,  PODELL Sheila (Univ. California at San Diego, CA) ,  HESS Wolfgang R. (Univ. Freiburg, Freiburg, DEU) ,  KLAGES Sven (Max Planck Inst. Molecular Genetics, Berlin, DEU) ,  ESQUENAZI Eduardo (Univ. California at San Diego, CA) ,  NIESSEN Sherry (Scripps Res. Inst., CA) ,  HOOVER Heather (Scripps Res. Inst., CA) ,  ROTHMANN Michael (Univ. California at San Diego, CA) ,  LASKEN Roger S. (J. Craig Venter Inst., CA) ,  YATES John R., III (Scripps Res. Inst., CA) ,  REINHARDT Richard (MPI for Plant Breeding Res., Cologne, DEU) ,  KUBE Michael (Max Planck Inst. Molecular Genetics, Berlin, DEU) ,  BURKART Michael D. (Univ. California at San Diego, CA) ,  ALLEN Eric E. (Univ. California at San Diego, CA) ,  DORRESTEIN Pieter C. (Univ. California at San Diego, CA) ,  GERWICK William H. (Univ. California at San Diego, CA) ,  GERWICK Lena (Univ. California at San Diego, CA)
資料名： Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  (Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America)
巻： 108  号： 21  ページ： 8815-8820  発行年： 2011年05月24日 
JST資料番号： D0387A  ISSN： 0027-8424  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Lyngbya属のシアノバクテリアは,サンゴ礁の生態系に重要な貢献をし,生理活性二次代謝産物を豊富に含む。Lyngbyaの天然産物を計測し,潜在的微生物相互作用についての洞察を得るため,サンガー法と454配列決定アプローチを組み合わせてLyngbya majuscula 3Lのゲノム配列を決定した。L.majusculaのゲノム配列は,クラシンAおよびバルバミドの完全な遺伝子クラスタを含んでいた。ドラフトゲノムの~293,000ヌクレオチドが推定的に二次代謝産物に割り当てられるが,これは,Lyngbyaの多数の代謝物をコードするにはかなり少なく,Lyngbyaの代謝物は,系統特異的であり種の描写に有用なようである。L.majusculaは,多数のσ因子と他の調節蛋白質を含む複雑な遺伝子調節ネットワークをもち,これが,環境順応能または微生物相互作用能を増大させる。L.majuscula 3Lは,窒素固定できないことを明らかにした。

シソーラス用語： *ユレモ科 ,  *ゲノム ,  窒素固定 ,  σ因子 ,  二次代謝産物 ,  環境順応 ,  ヌクレオチド配列 ,  塩基組成 ,  海洋微生物 ,  GC含量 ,  *Lyngbya majuscula ,  遺伝子調節ネットワーク ,  遺伝子発現調整 ,  *微生物 ,  *植物 ,  *シアノバクテリア門 ,  *隠花植物 ,  遺伝
準シソーラス用語： 遺伝的調節

分類 (3件)： 物質の代謝  (EH02050Q) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  植物生態学  (EE02000E)

物質索引 (2件)： クラシンA ,  バルバミド

タイトルに関連する用語 (7件)： 海洋 ,  シアノバクテリア ,  Lyngbya ,  生理学 ,  生態 ,  ゲノム ,  洞察