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J-GLOBAL ID：201102238819634021   整理番号：11A0922994

Lentinula edodes(シイタケ)のEST資源におけるSSR情報の分析

Analysis of SSR Information in EST Resource of Lentinus edodes

著者 (7件)： WANG Yan-fang (Coll. of Life Sci., Ludong Univ., Shandong, Yantai) ,  ZHAO Yan-hong (Coll. of Life Sci., Ludong Univ., Shandong, Yantai) ,  WANG Ai-yun (Coll. of Life Sci., Ludong Univ., Shandong, Yantai) ,  WANG Qin-qin (Coll. of Life Sci., Ludong Univ., Shandong, Yantai) ,  LIU Lin-de (Coll. of Life Sci., Ludong Univ., Shandong, Yantai) ,  ZHOU Rui-lian (Coll. of Life Sci., Ludong Univ., Shandong, Yantai) ,  YU Xiao-fei (Coll. of Life Sci., Ludong Univ., Shandong, Yantai)
資料名： Shipin Kexue  (Shipin Kexue)
巻： 31  号： 1  ページ： 137-140  発行年： 2010年 
JST資料番号： C2151A  ISSN： 1002-6630  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 単純配列反復(SSR)を,NCBIのLentinula edodes(シイタケ)のヌクレオチドESTデータベースからダウンロードした12144の適切なESTにおいて研究した。Lentinula edodes(シイタケ)のすべてのEST配列において359SSRがあり,それらは243di-(67.69%),114tri-(31.76%),1penta-(0.28%)および1hexa-(0.28%)ヌクレオチドSSRで構成された。SSRの推定の周波数は,33.8FATSあたり約1SSRであった。SSRの全長は7727kbであり,総EST配列の約2.94%を占めた。加えて,著者らは,Lentinula edodes(シイタケ)の100EST配列を選択し,EST-SSRマーカーのために100プライマー対を設計し,その中の20を任意に選択し,合成した。これらのプライマーの選択と調査を,Lentinula edodes(シイタケ)の4つの野生タイプの菌株で実施した。16プライマー対が明確で安定性目標圏によって特性評価されその中の11が遺伝的多様性を示した。著者らの所見は,本研究で開発したこれらのLentinula edodes(シイタケ)のEST-SSRマーカーが,有用効果的であることを示した。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST

シソーラス用語： *シイタケ ,  マイクロサテライト ,  データベース ,  DNAマーカー ,  ダウンロード ,  ヌクレオチド ,  生物多様性
準シソーラス用語： *Lentinula edodes ,  SSR ,  ESTデータベース ,  SSRマーカー ,  遺伝的多様性

分類 (1件)： 植物の生化学  (EH01050J)

タイトルに関連する用語 (6件)： Lentinula ,  シイタケ ,  EST ,  資源 ,  SSR ,  分析