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J-GLOBAL ID：201102243632576471   整理番号：11A0996322

ナツメヤシ(Phoenix dactylifera)の新規ゲノム配列解読および比較ゲノミクス

De novo genome sequencing and comparative genomics of date palm (Phoenix dactylifera)

著者 (17件)： AL-DOUS Eman K (Weill Cornell Medical Coll. in Qatar, Doha, QAT) ,  GEORGE Binu (Weill Cornell Medical Coll. in Qatar, Doha, QAT) ,  AL-MAHMOUD Maryam E (Weill Cornell Medical Coll. in Qatar, Doha, QAT) ,  AL-JABER Moneera Y (Weill Cornell Medical Coll. in Qatar, Doha, QAT) ,  SALAMEH Yasmeen M (Weill Cornell Medical Coll. in Qatar, Doha, QAT) ,  AL-AZWANI Eman K (Weill Cornell Medical Coll. in Qatar, Doha, QAT) ,  MALEK Joel A (Weill Cornell Medical Coll. in Qatar, Doha, QAT) ,  WANG Hao (Univ. Georgia, Georgia, USA) ,  CHALUVADI Srinivasa (Univ. Georgia, Georgia, USA) ,  PONTAROLI Ana C (Univ. Georgia, Georgia, USA) ,  DEBARRY Jeremy (Univ. Georgia, Georgia, USA) ,  BENNETZEN Jeffrey L (Univ. Georgia, Georgia, USA) ,  ARONDEL Vincent (Univ. V. Segalen Bordeaux, Bordeaux, FRA) ,  OHLROGGE John (Michigan State Univ., Michigan, USA) ,  SAIE Imad J (Agricultural and Water Res., Ministry of Environment, Doha, QAT) ,  SULIMAN-ELMEER Khaled M (Biotechnology Centre, Ministry of Environment, Doha, QAT) ,  KRUEGGER Robert R (Univ. California, California, USA)
資料名： Nature Biotechnology  (Nature Biotechnology)
巻： 29  号： 6  ページ： 521-527  発行年： 2011年06月07日 
JST資料番号： H0870A  ISSN： 1087-0156  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ナツメヤシは,中東および北アフリカで栽培される木本作物として経済的に極めて重要なものであり,乾燥環境の農業生産力を向上させる有力な候補となっている。しかし,世代時間が長く(5~8年),雌雄異株であるため,栽培および遺伝子解析が困難である。この問題に取り組むため,我々はカラス種のナツメヤシの雌株の概要ゲノム配列を組み立てた。これは,ヤシ目の植物に関するその種の資源としては,初めて一般公開されるものである。主に遺伝子が豊富な領域に広がっている約380Mbの配列には遺伝子モデルが2万5,000個以上含まれ,これが遺伝子の約90%およびゲノムの約60%をカバーすると推定されている。デグレット・ノール種およびメドジュール種の雌株,および戻し交雑したその雄株など,それ以外の8種類の栽培種の配列解読により,1万か所以上の遺伝子コピー数多型を含む350万か所以上の多型部位が発見された。この多型のごく一部によって複数の品種を識別することができる。我々は,性別と関連するゲノム領域を特定し,ナツメヤシの性別遺伝がXY型であることを示す証拠を発見した。Copyright Nature Publishing Group 2011

シソーラス用語： *ナツメヤシ ,  ゲノム ,  *遺伝子多型 ,  *雌雄異体 ,  *ヌクレオチド配列 ,  *遺伝学 ,  *コピー数 ,  *性差 ,  染色体 ,  性染色体
準シソーラス用語： Phoenix dactylifera ,  *ゲノミクス ,  *遺伝子コピー数多型 ,  *雌雄異株 ,  性別遺伝 ,  *比較ゲノミクス

分類 (2件)： 生殖  (EH02040F) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (5件)： ナツメヤシ ,  Phoenix ,  ゲノム配列 ,  解読 ,  比較ゲノミクス