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J-GLOBAL ID：201102251302892906   整理番号：11A0295145

精確整列選別のための指標を備えた複数オブジェクト対合RNA配列整列のためのウェブサーバー

A Web Server for Multi-objective Pairwise RNA Sequence Alignment with an Index for Selecting Accurate Alignments

著者 (1件)： TANEDA Akito (Graduate School of Sci. and Technol., Hirosaki Univ.)
資料名： IPSJ Transactions on Bioinformatics (Web)  (IPSJ Transactions on Bioinformatics (Web))
巻： 4  ページ： 2-8 (J-STAGE)  発行年： 2011年 
JST資料番号： U0111A  ISSN： 1882-6679  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 日本 (JPN)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 非コードRNAとそれらの情報学的ツールの重要度は,既知の非コ...

シソーラス用語： *RNA【核酸】 ,...
準シソーラス用語： *Cofolga2mo ,...

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分類 (1件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

引用文献 (25件)：

• 1) Griffiths-Jones, S., Saini, H.K., van Dongen, S. and Enright, A.J.: miRBase: Tools for microRNA genomics, Nucleic Acids Res., Vol.36, pp.D154-158 (2008).
• 2) Rogers, J. and Wall, R.: A mechanism for RNA splicing, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., Vol.77, pp.1877-1879 (1980).
• 3) Brown, J.W.: The Ribonuclease P Database, Nucleic Acids Res., Vol.27, p.314 (1999).
• 4) Sankoff, D.: Simultaneous solution of the RNA folding, alignment and protosequence problems, SIAM J. Appl. Math., Vol.45, pp.810-825 (1985).
• 5) Tabei, Y., Tsuda, K., Kin, T. and Asai, K.: SCARNA: Fast and accurate structural alignment of RNA sequences by matching fixed-length stem fragments, Bioinformatics, Vol.22, pp.1723-1729 (2006).

タイトルに関連する用語 (9件)： 精確 ,  整列 ,  選別 ,  指標 ,  オブジェクト ,  対合 ,  RNA ,  配列整列 ,  ウェブサーバー