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J-GLOBAL ID：201102252651828014   整理番号：11A0582243

Photobacteriumの系統発生,ゲノミクス及び共生

Phylogeny, genomics, and symbiosis of Photobacterium

著者 (3件)： URBANCZYK Henryk (Univ. Miyazaki, Miyazaki, JPN) ,  AST Jennifer C. (Uppsala Univ., Uppsala, SWE) ,  DUNLAP Paul V. (Univ. Michigan, MI, USA)
資料名： FEMS Microbiology Reviews  (FEMS Microbiology Reviews)
巻： 35  号： 2  ページ： 324-342  発行年： 2011年03月 
JST資料番号： W0860A  ISSN： 0168-6445  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 文献レビュー  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 通性嫌気性で運動性のグラム陰性菌であり,一般的に海産動物との関連で見出されているVibrionaceae科の数種類の菌種からなるPhotobacterium属の現状を系統発生,ゲノミクス及び共生相関関係から概説した。Photobacteriumの概略及び細菌発光(lux)遺伝子を細菌luxオペロン及びその進化から詳述し,7菌種がlux遺伝子のluxCDABEGの活性により輝いていることを示した。系統発生とDNA配列,多重ハウスキーピング遺伝子及びlux遺伝子に基づく系統発生,luxオペロンの部分接合体,並びに水平遺伝子転移について詳述した。系統発生分析によりPhotobacteriumと密接な関連菌2種類,Aliivibrio及びVibrio間が確実に分離されていることを証明した。また,Photobacteriumにはクレード2種類,発光及び非発光の菌種からなるクレード1及び大部分が非発光菌種のクレード2が存在することを示した。ゲノムサイズ及び体制,多重rDNAオペロン,プラスミド,比較ゲノム分析,転移因子及びゲノム進化,高圧好冷条件への適応関連遺伝子,並びにメタゲノミクスについて詳述した。Photobacteriumのゲノムは不等サイズの染色体2種類及び多重rrnオペロンを有する類似のサイズ,構造及び体制である。非特異的及び病原性関連,特異的共生関連,共生細菌-宿主特異性再検査,生体発光共生での共生細菌-宿主共分岐検査,環境調和,並びに共生の発端について詳述した。多くの海洋魚は主として3菌種,Photobacterium kishitanii,P.leiognathi及びP.mandapamensisと生体発光共生を形成し,関連性が強いけれど,厳密に種特異的ではなく,かつ共生細菌-宿主共分岐を示していなかった。

シソーラス用語： *発光菌属 ,  *系統発生 ,  遺伝学 ,  Vibrio ,  Vibrionaceae ,  ヌクレオチド配列 ,  DNA【核酸】 ,  ハウスキーピング遺伝子 ,  遺伝子 ,  オペロン ,  接合子 ,  分子遺伝現象 ,  生物ルミネセンス ,  *ゲノム ,  プラスミド ,  転移性遺伝要素 ,  分子進化 ,  病原性 ,  *共生 ,  選択性
準シソーラス用語： Aliivibrio ,  Photobacterium kishitanii ,  Photobacterium mandapamensis ,  Photobacterium leiognathi ,  rDNA ,  rrnオペロン ,  ゲノミクス ,  ゲノム進化 ,  メタゲノミクス ,  水平遺伝子転移 ,  生体発光 ,  接合体 ,  転移因子 ,  比較ゲノム分析 ,  部分接合体 ,  lux遺伝子

分類 (2件)： 微生物学(ウイルス以外)一般  (EG03010C) ,  異種生物間相互作用  (EE01050A)

タイトルに関連する用語 (4件)： Photobacterium ,  系統発生 ,  ゲノミクス ,  共生