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J-GLOBAL ID：201102257230009970   整理番号：11A0805830

TDP43がRNAを標的にして部位依存性スプライシングを制御するのを特性化

Characterizing the RNA targets and position-dependent splicing regulation by TDP-43

著者 (19件)： TOLLERVEY James R (Medical Res. Council (MRC) Lab. Molecular Biology, Cambridge, GBR) ,  CURK Tomaz (Univ. Ljubljana, Ljubljana, SVN) ,  ROGELJ Boris (King’s Coll. London, London, GBR) ,  BRIESE Michael (Medical Res. Council (MRC) Lab. Molecular Biology, Cambridge, GBR) ,  CEREDA Matteo (Medical Res. Council (MRC) Lab. Molecular Biology, Cambridge, GBR) ,  CEREDA Matteo (Scientific Inst. IRCCS E. Medea, Bosisio Parini (LC), ITA) ,  KAYIKCI Melis (Medical Res. Council (MRC) Lab. Molecular Biology, Cambridge, GBR) ,  KOENIG Julian (Medical Res. Council (MRC) Lab. Molecular Biology, Cambridge, GBR) ,  HORTOBAGYI Tibor (King’s Coll. London, London, GBR) ,  NISHIMURA Agnes L (King’s Coll. London, London, GBR) ,  ZUPUNSKI Vera (Univ. Ljubljana, Ljubljana, SVN) ,  ZUPUNSKI Vera (King’s Coll. London, London, GBR) ,  PATANI Rickie (MRC Lab. Regenerative Medicine, Cambridge, GBR) ,  CHANDRAN Siddharthan (MRC Lab. Regenerative Medicine, Cambridge, GBR) ,  CHANDRAN Siddharthan (Univ. Edinburgh, GBR) ,  ROT Gregor (Univ. Ljubljana, Ljubljana, SVN) ,  ZUPAN Blaz (Univ. Ljubljana, Ljubljana, SVN) ,  SHAW Christopher E (King’s Coll. London, London, GBR) ,  ULE Jernej (Medical Res. Council (MRC) Lab. Molecular Biology, Cambridge, GBR)
資料名： Nature Neuroscience  (Nature Neuroscience)
巻： 14  号： 4  ページ： 452-458  発行年： 2011年04月 
JST資料番号： W1370A  ISSN： 1097-6256  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 前頭側頭葉変性(FTLD)や筋萎縮性側索硬化症(ALS)で細胞核に封入体を形成するRNA結合蛋白質TDP43の標的はほとんど不明なので,個々のヌクレオチド分解能のUVクロスリンクと免疫沈降を組合せた手法(iCLIP)により解析してみると,TDP43はin vivoでUGリッチな配列の長いクラスターに選択的に結合した。FTLD患者脳でTDP43に結合するRNAはMALAT1やNEAT1の非コードRNAに強く結合するようになっていた。TDP43がプレmRNAに結合するとNova蛋白質と同様に選択的スプライシングが調節された。発現を抑制されるエキソンの下流のイントロンにエキソンからかなりはなれてTDP43の結合部位が存在した。TDP43により選択的スプライシングを調節されるmRNAにはニューロンの発生制御蛋白質や神経疾患関連蛋白質もかなり含まれるので,TDP43は脳内の選択的スプライシングを介して重要な役割をしていると推測された。

シソーラス用語： 認知症 ,  *RNA結合タンパク質 ,  ヌクレオチド配列 ,  結合部位 ,  イントロン ,  *選択的スプライシング ,  筋萎縮性側索硬化症 ,  ヒト ,  免疫沈降反応 ,  神経芽細胞
準シソーラス用語： *TDP-43 ,  クロマチン免疫沈降 ,  前頭側頭葉変性症

分類 (2件)： 神経の基礎医学  (GN01020W) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (6件)： TDP43 ,  RNA ,  標的 ,  依存性 ,  スプライシング ,  特性化