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J-GLOBAL ID：201102277466197779   整理番号：11A1469310

ショットガンcDNAクローニングによる絶滅の危機にあるカエルOdorrana ishikawae皮膚の新しい抗菌ペプチドの特徴

Characterization of novel antimicrobial peptides from the skin of the endangered frog Odorrana ishikawae by shotgun cDNA cloning

著者 (6件)： IWAKOSHI-UKENA Eiko (Section of Life Sci., Graduate School of Integrated Arts and Sciences, Hiroshima Univ., Higashi-Hiroshima 739-8521, JPN) ,  SOGA Miyuki (Dep. of Health Sciences, Hiroshima Prefectural Univ., Hiroshima 734-8558, JPN) ,  OKADA Genya (Dep. of Health Sciences, Hiroshima Prefectural Univ., Hiroshima 734-8558, JPN) ,  FUJII Tamotsu (Dep. of Health Sciences, Hiroshima Prefectural Univ., Hiroshima 734-8558, JPN) ,  SUMIDA Masayuki (Inst. for Amphibian Biology, Graduate School of Sci., Hiroshima Univ., Higashi-Hiroshima 739-8526, JPN) ,  UKENA Kazuyoshi (Section of Life Sci., Graduate School of Integrated Arts and Sciences, Hiroshima Univ., Higashi-Hiroshima 739-8521, JPN)
資料名： Biochemical and Biophysical Research Communications  (Biochemical and Biophysical Research Communications)
巻： 412  号： 4  ページ： 673-677  発行年： 2011年09月09日 
JST資料番号： B0118A  ISSN： 0006-291X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 我々は以前に,絶滅の危機にある無尾類種,Odorrana ishikawaeの皮膚から9種類の新しい抗菌ペプチドの一次構造,抗菌活性およびcDNA前駆体を報告した。これらcDNAクローンは,開始コドンの上流に良く保存された約60bpの領域を明らかにした。この保存された領域を,ショットガンcDNAクローニング法に用い,O. ishikawaeの新しい抗菌ペプチドをコードする,更なるcDNAを明らかにした。344クローンの配列決定後,以前に同定されている,9種類の抗菌ペプチドに加え,皮膚ペプチドをコードする新しい13 cDNAsを同定した。これら13の特異なcDNAsは,各々がシグナルペプチド,N末端酸性スペーサードメイン,Lys-Arg/Lysプロセッシング部位およびC末端皮膚ペプチドを有する前駆体蛋白質をコードした。皮膚ペプチドは,パルストリン-2(2種類のペプチド;パルストリン-2IScおよびパルストリン-2ISdと命名),ニグロシン-2(1ペプチド;ニグロシン-2ISc),ブレビニン-1(1ペプチド;ブレビニン-1ISa),オドランナイン-M(1ペプチド;オドランナイン- MISa)および全く新しいペプチド(8ペプチド;イシカワイン-1~8)のメンバーであった。パルストリン-2ISdとオドランナイン- MISaは,狭い抗菌活性を示したが,パルストリン-2IScおよびニグロシン-2IScは,細菌に対し広い範囲の増殖阻害を示した。ブレビニン-1ISaは,グラム陽性菌と真菌に対し最も強い抗菌活性を示したが,グラム陰性菌,大腸菌には示さなかった。しかしながら,8種類の新しいペプチドは,これら微生物に対し増殖阻害を示さなかった。Copyright 2011 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： *アカガエル科 ,  *遺伝子クローニング ,  生物 ,  *ペプチド ,  アミノ酸配列 ,  遺伝学実験技術 ,  皮膚 ,  タンパク質プロセシング ,  絶滅危惧種 ,  *cDNAクローニング ,  *抗菌ペプチド ,  配列アライメント ,  *イシカワガエル
準シソーラス用語： *Odorrana ishikawae ,  パルストリン

分類 (1件)： 生理活性ペプチド  (EB08100U)

タイトルに関連する用語 (6件)： ショットガン ,  cDNAクローニング ,  絶滅 ,  カエル ,  皮膚 ,  抗菌ペプチド