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J-GLOBAL ID：201102292258197861   整理番号：11A1938688

コンセンサスSVM-RFEによるスパースで安定な遺伝子選択

Sparse and stable gene selection with consensus SVM-RFE

著者 (6件)： TAPIA E. (CIFASIS - Conicet, Centro Internacional Franco Argentino de Ciencias de la Informacion y de Sistemas, 27 de Febrero ...) ,  TAPIA E. (Facultad de Ciencias Exactas, Ingenieria y Agrimensura, Universidad Nacional de Rosario, Riobamba 245 bis, Rosario, ARG) ,  BULACIO P. (CIFASIS - Conicet, Centro Internacional Franco Argentino de Ciencias de la Informacion y de Sistemas, 27 de Febrero ...) ,  BULACIO P. (Facultad de Ciencias Exactas, Ingenieria y Agrimensura, Universidad Nacional de Rosario, Riobamba 245 bis, Rosario, ARG) ,  ANGELONE L. (CIFASIS - Conicet, Centro Internacional Franco Argentino de Ciencias de la Informacion y de Sistemas, 27 de Febrero ...) ,  ANGELONE L. (Facultad de Ciencias Exactas, Ingenieria y Agrimensura, Universidad Nacional de Rosario, Riobamba 245 bis, Rosario, ARG)
資料名： Pattern Recognition Letters  (Pattern Recognition Letters)
巻： 33  号： 2  ページ： 164-172  発行年： 2012年01月15日 
JST資料番号： H0913A  ISSN： 0167-8655  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 多数の不安定な,しかし安価な遺伝子からスパースで安定な遺伝子選択を行うための方法,SVM-RFEサブユニットと呼ぶSVM-RFEユニットについて述べた。総合的なシミュレーション研究によって,遺伝子除去のポリシーにおける変動に関連するコンセンサス制約および訓練データにおける摂動に関連する安定性制約の導入が遺伝子選択精度を顕著に改善できることを示した。そして次元縮小比の抑制および低価格SVM-RFEサブユニットの安定性がなおも可能な計算コストを保証し続けている。この方法を,選択する遺伝子の数の事前選択を要せず,2段階に分割した。はじめに,複数の粗遺伝子除去ポリシーを複数のデータセットの代理訓練(拡散)に適用した。次に,遺伝子除去ポリシーの変動に関連する複数のコンセンサス遺伝子集合を得て,遺伝子集合の最良行為(逆拡散)を選択する安定化フィルタを通過させた。したがって,コンセンサス制約は可能な計算コストにおいて強力な次元縮小を行いながら,安定性制約は遺伝子選択安定性の許容し得る指標とさらなる次元縮小を確実にする。この方法を3種のベンチマークマイクロアレイデータセットによって検証した。Copyright 2011 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： *遺伝現象 ,  *サポートベクトルマシン ,  意思決定 ,  安定性 ,  次元縮小 ,  原価 ,  集合
準シソーラス用語： *SVM-RFE ,  コンセンサス ,  データセット ,  遺伝子安定性 ,  *遺伝子選択 ,  計算コスト

分類 (1件)： 遺伝子操作  (EC02050B)

タイトルに関連する用語 (3件)： コンセンサス ,  SVM ,  遺伝子選択