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J-GLOBAL ID：201102293300254540   整理番号：11A0927947

バナナ萎縮病ウイルスHaikou(海口)分離株ゲノムのクローニングおよびシークエンシング

Cloning and sequencing of genome of banana bunchy top virus Haikou isolate

著者 (3件)： FENG Tuan-cheng (Inst. of Tropical Bioscience and Biotechnology,CATAS, Hainan, Haikou) ,  WANG Jian-hua (Inst. of Tropical Bioscience and Biotechnology,CATAS, Hainan, Haikou) ,  LIU Zhi-xin (Inst. of Tropical Bioscience and Biotechnology,CATAS, Hainan, Haikou)
資料名： Zhiwu Bingli Xuebao  (Zhiwu Bingli Xuebao)
巻： 40  号： 1  ページ： 40-50  発行年： 2010年 
JST資料番号： C2145A  ISSN： 0412-0914  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 海口産バナナの偽茎(pseudostem)およびテンプレートとして,典型的なBBTV症状を示す葉の全DNAを用いて,バナナ萎縮病ウイルス分離株ゲノムをPCRによりクローニングおよびシークエンシングした。分離株はバナナ(Musa sp.)のBBTV海口系統であった。シーケンス分析の結果,6つの全長セグメントはそれぞれ1106,1040,1058,1040,1013および1082 ntであった。セグメント1以外,すべてのセグメントは遺伝子間領域およびオープンリーディングフレーム(ORF)を含んでいた。セグメント1における主なORFのORFは小さかった。遺伝子間領域(IR)では,stem-loop common region(CR-SL)およびmajor common region(CR-M)があり,それぞれ,遺伝子の91.55%および88.45%を共有していた。他の場所からのウィルスシーケンスの比較から,DNA1シーケンスは他の成分より低めであったが,しかし,DNA2のシーケンス突然変異率は他より高く,93.08%および75.67%の相同性を共有していた。分離株のDNA1およびBBTVのアジアグループ,太平洋グループおよびABTV(Abac(a) バナナ萎縮病ウイルス)の2つの分離株間のヌクレオチド配列解析の結果,BBTV-海口のDNA1は93.1%-99.1%,89.6%-90.7%および76.2%-77.4%のヌクレオチド配列を共有していることが分かった。BBTVおよびABTVにおいて,推定されたアミノ酸の同一性もそれぞれ93.4%~100%および85.7%であった。Karanの方法による分類の結果,BBTV-海口分離株はアジアグループに属していることが明らかとなった。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST

シソーラス用語： *バナナ ,  *萎縮病 ,  *植物ウイルス ,  *遺伝子クローニング ,  *遺伝学実験技術 ,  アミノ酸配列 ,  DNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  突然変異 ,  相同性 ,  ヌクレオチド配列 ,  植物病害
準シソーラス用語： オープンリーディングフレーム ,  クローニング ,  *シークエンス分析 ,  ヌクレオチド配列相同性 ,  遺伝子間領域

分類 (3件)： 遺伝的変異  (EC01030Y) ,  果樹  (FC03042G) ,  ウイルスによる植物病害  (FC04054G)

タイトルに関連する用語 (8件)： バナナ ,  萎縮病 ,  ウイルス ,  海 ,  分離株 ,  ゲノム ,  クローニング ,  シークエンシング