BKウイルスのゲノム型を判定するためのオリゴヌクレオチドプローブ及びマイクロアレイ

発明者： , ,
出願人/特許権者： ,
代理人 (2件)：平木祐輔 , 藤田節
公報種別：再公表公報
出願番号（国際出願番号）：JP2009057337
公開番号（公開出願番号）：WO2009-128399
出願日： 2009年04月10日
公開日（公表日）： 2009年10月22日
要約：

本発明は、被検者に感染したBKウイルスのゲノム型を迅速・簡便に判定し、被検者の出身地を推定するための手段を提供する。本発明は、オリゴヌクレオチドプローブ(a-1)、(a-2)、(a-3)及び(a-4);オリゴヌクレオチドプローブ(b-1)、(b-2)、(b-3)及び(b-4);オリゴヌクレオチドプローブ(c-1)、(c-2)及び(c-3);オリゴヌクレオチドプローブ(d-1)、(d-2)及び(d-3);並びにオリゴヌクレオチドプローブ(e-1)、(e-2)及び(e-3)を含む、被検者に感染したBKウイルスのゲノム型を判定するためのオリゴヌクレオチドプローブのセットに関する。

請求項（抜粋）：

以下のオリゴヌクレオチドプローブを含む、被検者に感染したBKウイルスのゲノム型を判定するためのオリゴヌクレオチドプローブのセット: (a-1)配列番号1、2又は3の223〜241番目の塩基を含む連続した30塩基以下の塩基配列またはそれに相補的な塩基配列からなるオリゴヌクレオチドプローブ (a-2)配列番号4の223〜241番目の塩基を含む連続した30塩基以下の塩基配列またはそれに相補的な塩基配列からなるオリゴヌクレオチドプローブ (a-3)配列番号5又は6の223〜241番目の塩基を含む連続した30塩基以下の塩基配列またはそれに相補的な塩基配列からなるオリゴヌクレオチドプローブ (a-4)配列番号7の223〜241番目の塩基を含む連続した30塩基以下の塩基配列またはそれに相補的な塩基配列からなるオリゴヌクレオチドプローブ (b-1)配列番号1、2又は4の271〜290番目の塩基を含む連続した30塩基以下の塩基配列またはそれに相補的な塩基配列からなるオリゴヌクレオチドプローブ (b-2)配列番号3の271〜290番目の塩基を含む連続した30塩基以下の塩基配列またはそれに相補的な塩基配列からなるオリゴヌクレオチドプローブ (b-3)配列番号5又は6の271〜290番目の塩基を含む連続した30塩基以下の塩基配列またはそれに相補的な塩基配列からなるオリゴヌクレオチドプローブ (b-4)配列番号7の271〜290番目の塩基を含む連続した30塩基以下の塩基配列またはそれに相補的な塩基配列からなるオリゴヌクレオチドプローブ (c-1)配列番号1、4、5、6又は7の285〜304番目の塩基を含む連続した30塩基以下の塩基配列またはそれに相補的な塩基配列からなるオリゴヌクレオチドプローブ (c-2)配列番号2又は3の285〜304番目の塩基を含む連続した30塩基以下の塩基配列またはそれに相補的な塩基配列からなるオリゴヌクレオチドプローブ (c-3)配列番号7の285〜304番目の塩基を含む連続した30塩基以下の塩基配列またはそれに相補的な塩基配列からなるオリゴヌクレオチドプローブ (d-1)配列番号1の53〜72番目の塩基を含む連続した30塩基以下の塩基配列またはそれに相補的な塩基配列からなるオリゴヌクレオチドプローブ (d-2)配列番号2、4、5、6又は7の53〜72番目の塩基を含む連続した30塩基以下の塩基配列またはそれに相補的な塩基配列からなるオリゴヌクレオチドプローブ (d-3)配列番号3の53〜72番目の塩基を含む連続した30塩基以下の塩基配列またはそれに相補的な塩基配列からなるオリゴヌクレオチドプローブ (e-1)配列番号1、2、3又は4の81〜100番目の塩基を含む連続した30塩基以下の塩基配列またはそれに相補的な塩基配列からなるオリゴヌクレオチドプローブ (e-2)配列番号5又は6の81〜100番目の塩基を含む連続した30塩基以下の塩基配列またはそれに相補的な塩基配列からなるオリゴヌクレオチドプローブ (e-3)配列番号7の81〜100番目の塩基を含む連続した30塩基以下の塩基配列またはそれに相補的な塩基配列からなるオリゴヌクレオチドプローブ。

IPC (3件)：

C12Q 1/68 , C12N 15/09 , C12M 1/00

FI (4件)：

C12Q1/68 A , C12N15/00 A , C12M1/00 A , C12N15/00 F

Fターム (34件)：

4B024AA14 , 4B024CA01 , 4B024CA09 , 4B024HA08 , 4B024HA12 , 4B029AA07 , 4B029AA21 , 4B029AA23 , 4B029BB13 , 4B029BB20 , 4B029CC03 , 4B029FA01 , 4B029GA08 , 4B029GB09 , 4B063QA05 , 4B063QA18 , 4B063QA20 , 4B063QQ02 , 4B063QQ08 , 4B063QQ10 , 4B063QQ42 , 4B063QR08 , 4B063QR32 , 4B063QR42 , 4B063QR50 , 4B063QR55 , 4B063QR62 , 4B063QR66 , 4B063QR79 , 4B063QS25 , 4B063QS28 , 4B063QS34 , 4B063QS36 , 4B063QX02

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