特許
J-GLOBAL ID：201103081580190409
RNA配列解析装置、RNA配列解析方法、プログラム、および、記録媒体
発明者：
,
出願人/特許権者：
代理人 (2件)：
酒井 宏明
, 香島 拓也
公報種別：特許公報
出願番号（国際出願番号）：特願2001-402081
公開番号（公開出願番号）：特開2003-203077
特許番号：特許第3881238号
出願日： 2001年12月28日
公開日（公表日）： 2003年07月18日
請求項（抜粋）：
【請求項1】制御装置と記憶装置と入力装置と出力装置とを少なくとも備えたRNA配列解析装置において、
上記記憶装置は、
RNA二次構造の構造トポロジーに適合する複数の生成文法を記憶する文法格納手段、
を備え、
上記制御装置は、
利用者が上記入力装置を介して入力した二次構造を特定したいRNA配列を、上記文法格納手段にて記憶された上記複数の上記生成文法に適用して、上記生成文法毎に構文解析木を導出する構文解析手段と、
上記構文解析手段にて導出された各々の上記構文解析木に対して、塩基対数、平衡自由エネルギー、導出確率のうち少なくとも一つに基づいて適合度の計算を行う適合度計算手段と、
上記適合度計算手段により計算された各々の上記構文解析木に対する上記適合度が高い順に上記構文解析木をソートするソート手段と、
上記ソート手段によりソートされた上記構文解析木と上記適合度を上記出力装置に出力する出力手段と、
を備えたことを特徴とするRNA配列解析装置。
IPC (4件)：
G06F 19/00 ( 200 6.01)
, G06F 17/30 ( 200 6.01)
, C12M 1/00 ( 200 6.01)
, C12Q 1/68 ( 200 6.01)
G06F 19/00 600
, G06F 17/30 170 F
, C12M 1/00 ZNA A
, C12Q 1/68 Z
