資源
J-GLOBAL ID:201110019267311920   研究資源コード:5000003027 更新日:2009年03月03日

Genome Shovel

Genome Shovel
保有機関:
担当者: 黒田 雅子
資源分類: ソフトウエア、プログラム
研究分野 (1件): 基礎ゲノム科学
概要:
Genome Shovelは、アライメントエンジンとしてBLASTを用い、Web上での
ドットマトリクスDNA配列比較を行うシステムである。2本のDNA配列を
アップロードし、数種のパラメーターを選択することで容易にドットマトリクス
データが得られる。結果はe-mailで返され、記載された手順に従い、
グラフィカル表示をすることも出来る。BLASTを用いることにより、1Mb程度の
長い配列を処理することが可能である。
研究領域: 核酸配列解析
利用環境と条件:
次のURLに掲載
http://www-btls.jst.go.jp/cgi-bin/Tools/dotBLAST/index.cgi?lang=ja
利用手続きと方法:
[利用料金] 無料
[利用者の資格] なし
[利用上の制約] なし

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