資源
J-GLOBAL ID:201110080121090265   研究資源コード:5000002076 更新日:2003年06月02日

蛋白質多型データベース(dbProP)

Protain Polymorphism Database (dbProP)
保有機関:
担当者: 齋藤 俊行
資源分類: 生体物質(核酸、蛋白質、その他)
概要:
本データベースは、蛋白質多様性に着目する医学・生物学研究を支援する
ために、蛋白質コード領域に見出されるアミノ酸変化型SNP候補と可変的
スプライシングの情報を提供する。現在公開されている多数のヒト由来
EST(expressed sequence tag ; cDNA断片)に対して独自の配列
解析を行い、一定の判定基準に従い「アミノ酸変化を伴うDNA多型(SNP)」
候補を推定し、さらに公共データベースdbSNPに公開されているSNP情報
を加えた。広範な格納遺伝子群に加え、多型部位と蛋白質の特徴的構造と
の位置関係、多型検出用PCRプライマーの自動設計機能、関連データベー
スへの緊密なリンク等を備えており、蛋白質機能の個体差を意識する幅広
い分野の研究者にとって有用な研究ツールとなるように設計されている。
本データベースは、ミレニアム・プロジェクト及び科学技術振興事業団
(JST)の研究情報データベース化事業の1つとして放射線医学総合研究
所(NIRS)とJSTとの共同研究により開発された。
URL: http://dbprop.nirs.go.jp/Prop/index.html

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