研究者
J-GLOBAL ID:201201068306951227   更新日: 2025年04月07日

苙口 友隆

オログチ トモタカ | Tomotaka Oroguchi
所属機関・部署:
職名: 専任講師
研究分野 (1件): 生物物理、化学物理、ソフトマターの物理
研究キーワード (5件): X線溶液散乱 ,  分子動力学シミュレーション ,  蛋白質水和構造 ,  蛋白質ダイナミクス ,  生物物理、生体分子水和・ダイナミックス、X線ナノイメージング
競争的資金等の研究課題 (10件):
  • 2021 - 2024 水素結合の方向性を厳密に取り扱った高信頼度な蛋白質分子力場の開発
  • 2018 - 2023 新世代中性子構造生物学の開拓
  • 2017 - 2021 生体分子の機能発揮機構における水和構造の役割の解明
  • 2017 - 2020 分子クラウディング環境下における生体分子の機能的構造揺らぎの解析
  • 2016 - 2017 分子シミュレーションと溶液X線散乱実験を用いた生体分子の構造揺らぎの解析
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論文 (54件):
MISC (3件):
書籍 (1件):
  • Water and Biomolecules
    Springer-Verlag Berlin Heidelberg 2009
講演・口頭発表等 (56件):
  • Optimization of MD-derived conformational ensemble in information content space and its application to experimental X-ray solution scattering data
    (TSRC Proten Dynamiccs Workshop 2023)
  • MDシミュレーションと溶液散乱実験による蛋白質構造揺らぎの可視化: ベイズ学習の適用に向けて
    (情報計算化学生物学会2021年学会)
  • Protein structural fluctuations investigated by X-ray solution scattering and molecular dynamics simulation
    (第55回日本生物物理学会年会)
  • Protein conformational fluctuations and hydration structures investigated by the combination of MD simulations and X-ray experiments
    (TSRC Protein Dynamics Workshop 2017)
  • MDシミュレーションと溶液X線小角散乱で探る蛋白質の構造揺らぎ
    (第17回日本蛋白質科学会年会)
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学歴 (6件):
  • 2004 - 2007 東京大学 理学系研究科 物理学専攻
  • 2004 - 2007 東京大学 理学系研究科 物理学科
  • 2004 - 2007 東京大学 理学系研究科 物理学専攻
  • 2002 - 2004 東京大学 理学系研究科 物理学専攻
  • 2002 - 2004 東京大学 理学系研究科 物理学専攻
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学位 (1件):
  • 博士(理学) (東京大学)
経歴 (3件):
  • 2015/04 - 現在 慶應義塾大学 理工学部 物理学科 専任講師
  • 2011/04 - 2015/03 慶應義塾大学 理工学部 物理学科 助教
  • 2007/04 - 2011/03 横浜市立大学大学院 生命ナノシステム科学研究科 博士研究員
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