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J-GLOBAL ID：201202201161470590   整理番号：12A1773956

用心しながらのシグナルペプチド予測の使用: Aspergillus niger キシラナーゼの事例研究

Using signal peptide prediction with caution, a case study in Aspergillus niger xylanase

著者 (6件)： LIU Liangwei (Life Sci. Coll., Henan Agricultural Univ., Zhengzhou 450002, CHN) ,  CHEN Long (Life Sci. Coll., Henan Agricultural Univ., Zhengzhou 450002, CHN) ,  CHEN Long (Key Lab. of Enzyme Engineering of Agricultural Microbiology, Ministry of Agriculture, Zhengzhou 450002, CHN) ,  TIAN Hui (Coll. of Mechanical & Electrical Engineering, Henan Agricultural Univ., Zhengzhou 450002, CHN) ,  YANG Haiyu (Life Sci. Coll., Henan Agricultural Univ., Zhengzhou 450002, CHN) ,  ZHAO Li (Coll. of Mechanical & Electrical Engineering, Henan Agricultural Univ., Zhengzhou 450002, CHN)
資料名： Process Biochemistry  (Process Biochemistry)
巻： 47  号： 12  ページ： 2527-2530  発行年： 2012年12月 
JST資料番号： C0250B  ISSN： 1359-5113  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： シグナルペプチド(SP)予測が使われているが,正しいかどうかは不明である。Aspergillus niger GH10 キシラナーゼ(XynB) SPが1-19 (Met₁-Ser₁₉)残基であると予測され,Penicillium simplicissimumキシラナーゼ1-25残基SPと異なっている。本当のSPを決定するために,XynBの二つの型, XynΔ19及びXynΔ25をそれぞれ19(Met₁-Ser₁₉)あるいは25(Met₁-Arg₂₅)残基を消去することで構築した。XynΔ25はXynΔ19よりもT _opt が10°C高く,熱安定性は21.6倍長かった(46vs.36°C 及び47.6vs.2.2m).動力学を試験すると,XynΔ25はXynΔ19より V _maxは~2.1倍高く,キシランへの結合親和性は高かった(53.7vs.25.3μmol/ml/m及び2.43vs.2.96mg/ml)。かくてXynBの本当のSPは1-25であり,予測された1-19残基ではなかった。N末端のさらなる6残基(Glu₂₀Pro₂₁Ile₂₂Glu₂₃Pro₂₄Arg₂₅)はXynΔ19の熱的活性,熱安定性,及び触媒的効率を劇的に妨害した。Copyright 2012 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： *シグナルペプチド ,  *キシラナーゼ ,  アミノ酸配列 ,  アミノ酸残基 ,  熱安定性 ,  予測 ,  酵素反応速度論 ,  Aspergillus niger
準シソーラス用語： 黒色麹菌

分類 (2件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  酵素一般  (EB09010D)

タイトルに関連する用語 (6件)： 用心 ,  シグナルペプチド ,  予測 ,  Aspergillus ,  キシラナーゼ ,  研究