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J-GLOBAL ID:201202201934507021   整理番号:12A1200392

微生物相互作用: ネットワークからモデルへ

Microbial interactions: from networks to models
著者 (4件):
資料名:
巻: 10  号:ページ: 538-550  発行年: 2012年08月 
JST資料番号: W1394A  ISSN: 1740-1526  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 文献レビュー  発行国: イギリス (GBR)  言語: 英語 (EN)
抄録/ポイント:
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生態系において微生物は複雑な相互作用網を形成し,微生物共同体はフローサイトメトリー,マイクロアレイ,リボソームRNAやメタゲノム配列決定等の広範囲な技術によりモニターされている。微生物関連ネットワークは土壌/海洋共同体から人体共同体に渡る広範な環境に対して予想され,これらのデータセットで見出される共存あるいは相互排除パターンを示す微生物の組み合わせを同定し,それらをネットワークで結合させるための最先端の類似性/回帰に基づく技術を概説する。さらに,微生物の種間競争を証明する共培養と蛍光に基づくコンビナトリアル標識化戦略によるハイスループット実験による実験例より,これら推論ネットワークは共同体のスナップショットを表す静的モデルであり,微生物ネットワークの経時的現象を伴う研究には動的モデルが必要であることを指摘した。共同体の安定性,攪乱と遷移の3つの潜在的に重要な項目についても簡潔に紹介する。
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分類 (1件):
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微生物の生態 
タイトルに関連する用語 (2件):
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