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J-GLOBAL ID：201202202665052230   整理番号：12A0120677

大腸菌 O157:H7大流行のゲノム解剖

Genomic anatomy of Escherichia coli O157:H7 outbreaks

著者 (5件)： EPPINGER Mark (Univ. Maryland School of Medicine, MD) ,  MAMMEL Mark K. (US Food and Drug Administration, MD) ,  LECLERC Joseph E. (US Food and Drug Administration, MD) ,  RAVEL Jacques (Univ. Maryland School of Medicine, MD) ,  CEBULA Thomas A. (Johns Hopkins Univ., MD)
資料名： Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  (Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America)
巻： 108  号： 50  ページ： 20142-20147  発行年： 2011年12月13日 
JST資料番号： D0387A  ISSN： 0027-8424  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 大腸菌 O157:H7病原ゲノムの進化を理解するために,アメリカ合衆国においてほぼ同時に集団発生した食品由来疾患3件に関連する大腸菌O157:H7 25株の包括的高精度配列化と比較系統学的解析を行なった。又,患者,汚染製品,動物由来感染源から回収された231の関連株の集団遺伝子解析を行なった。高解像系統学的アプローチによって病原ゲノムの高レベルな系統学的精度と解像度を持つ進化ダイナミクスとその解析を行い,1,225の一塩基多型(SNP)を同定し,大腸菌O157:H7系統の型分けが可能になった。ゲノム構造及びプロファージ含有量の研究と合わせて,臨床及び環境分離株内における遺伝的多様性の範囲を査定するための多数のバイオマーカーを同定した。

シソーラス用語： *大腸菌O157 ,  *解析 ,  病原性 ,  生物進化 ,  系統樹 ,  一塩基多型 ,  *ヌクレオチド配列 ,  生物多様性 ,  バイオマーカー ,  プロファージ ,  遺伝子 ,  *系統解析 ,  stx遺伝子 ,  遺伝多様性 ,  *微生物 ,  *腸管病原性大腸菌
準シソーラス用語： *大腸菌O157:H7 ,  遺伝的多様性

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  微生物の生化学  (EG03020N)

タイトルに関連する用語 (6件)： 大腸菌 ,  O157 ,  H7 ,  大流行 ,  ゲノム ,  解剖