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J-GLOBAL ID：201202203382728993   整理番号：11A1543770

細菌外毒素配列および対応する遺伝子オントロジー分析における外毒素特異的モチーフ/領域の同定

Identification of exotoxin-specific motifs/domains in bacterial exotoxin sequences and corresponding Gene Ontology analysis

著者 (6件)： Niu Chao (Inst. of Hygiene and Environmental Medicine, Acad. of Military Medical Sciences, Tianjin) ,  Wang Yuelan (Biotechnology Inst. of Beijing, Acad. of Military Medical Sciences, State Key Lab. of Medical Microbiology and ...) ,  Yue Junjie (Biotechnology Inst. of Beijing, Acad. of Military Medical Sciences, State Key Lab. of Medical Microbiology and ...) ,  Ning Bao’an (Inst. of Hygiene and Environmental Medicine, Acad. of Military Medical Sciences, Tianjin) ,  Gao Zhixian (Inst. of Hygiene and Environmental Medicine, Acad. of Military Medical Sciences, Tianjin) ,  Liang Long (Biotechnology Inst. of Beijing, Acad. of Military Medical Sciences, State Key Lab. of Medical Microbiology and ...)
資料名： Weishengwu Xuebao  (Weishengwu Xuebao)
巻： 50  号： 9  ページ： 1246-1250  発行年： 2010年 
JST資料番号： C2382A  ISSN： 0001-6209  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 【目的】細菌外毒素配列における外毒素特異的モチーフ/領域を同定して,細菌外毒素病原性機構の理解を拡大する。【方法】著者らは非病原性細菌蛋白質データベースを構築して,病原性因子データベース(VFDB)からの89の細菌外毒素配列を採取し,次に著者らはInter ProScan(www.ebi.ac.uk/Tools/Inter ProScan/)を用いて,モチーフ/領域調査によってこれら蛋白質配列を分析した。【結果】著者らは,89の細菌外毒素配列において39の外毒素特異的モチーフ/領域を同定した。【結語】同定された外毒素特異的モチーフ/領域は,外毒素の機能にきわめて近縁で,病原性細菌のゲノムマイニングによる新規外毒素調査への鋳型として使用することができた。後天性遺伝子オントロジー(GO)アイテムの分析は,さらに細菌外毒素病原性機構の著者らの理解を広げることになった。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST

シソーラス用語： *外毒素 ,  オントロジー ,  データベース ,  病原体 ,  ゲノム ,  細菌 ,  タンパク質
準シソーラス用語： 細菌外毒素 ,  遺伝子オントロジー ,  蛋白質データベース ,  病原性因子 ,  非病原性菌

分類 (1件)： 微生物起原の毒性  (GZ03030F)

タイトルに関連する用語 (6件)： 細菌外毒素 ,  遺伝子オントロジー ,  分析 ,  外毒素 ,  モチーフ ,  同定