文献

J-GLOBAL ID：201202203803465466   整理番号：11A1716464

相加モチーフ及びパワースペクトル密度の組合せベクターに基づく27種類の蛋白質折畳みの予測

Predicting 27-Class Protein Folds Based on Combined Vector of Adding Motif and Power Spectral Density

著者 (2件)： Liu Lei (Coll. of Sciences, Inner Mongolia Univ. of Technol., Hohhot) ,  Hu Xiuzhen (Coll. of Sciences, Inner Mongolia Univ. of Technol., Hohhot)
資料名： Shengwu Wuli Xuebao  (Shengwu Wuli Xuebao)
巻： 26  号： 9  ページ： 823-832  発行年： 2010年 
JST資料番号： C2187A  ISSN： 1000-6737  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 40%以下の配列同一性を持つ1895蛋白質を含有する新たな蛋白質折畳みデータセットと27に分類された折畳みタイプを予測した。モチーフ頻度,パワースペクトル密度の低頻度,アミノ酸組成,組合せベクターとしての予測二次構造及び自己相関関数値を使った蛋白質配列に基づいて,集団分類子に基づく27種類の蛋白質折畳みを予測するサポートベクトルマシン法を提案した。オーバーオールの予測精度は独立した試験データセットにおいて66.67%に達した。同じ方法を用いた予測4折畳み構造分類のオーバーオールの精度は89.24%であった。以前の研究者により報告された予測データセットに対し,この結果は他より優れていた。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST

シソーラス用語： パワースペクトル密度 ,  ベクター ,  *折畳み構造 ,  相同性 ,  アミノ酸配列 ,  アミノ酸組成 ,  予測 ,  自己相関関数 ,  サポートベクトルマシン ,  精度 ,  配列相同性
準シソーラス用語： アミノ酸モチーフ ,  *蛋白質折畳み ,  配列同一性 ,  予測精度 ,  二次構造予測

分類 (1件)： 分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (6件)： モチーフ ,  パワースペクトル密度 ,  組合せ ,  ベクター ,  蛋白質折畳み ,  予測