文献

J-GLOBAL ID：201202204643521310   整理番号：12A0911083

大生体分子における基底関数重ね合せ誤差補正のための統計ベースのモデル

Statistics-based model for basis set superposition error correction in large biomolecules

著者 (3件)： FAVER John C. (Univ. Florida, FL, USA) ,  ZHENG Zheng (Univ. Florida, FL, USA) ,  MERZ Kenneth M., Jr. (Univ. Florida, FL, USA)
資料名： Physical Chemistry Chemical Physics  (Physical Chemistry Chemical Physics)
巻： 14  号： 21  ページ： 7795-7799  発行年： 2012年06月07日 
JST資料番号： A0271C  ISSN： 1463-9076  CODEN： PPCPFQ  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 生化学的接近ディスクリプタに基づく線形モデルにより分子フラグメント相互作用が区分され,解析される大きな生体分子系のための,基底関数系重なり誤差(BSSE)の見積りのための統計ベースのモデルを提示した。そのモデルは,種々のクラスの分子相互作用,量子論法及び基底関数系に対して独立に訓練される。予測誤差不確定性をもつ予測フラグメントBSSE値は,次いで超分子を介して伝搬され,BSSEの全見積りと関連する不確定性を得る。その方法を記述し,蛋白質-配位子錯体,小さい螺旋蛋白質及びPin1 WWドメインの天然の及びデコイフォルドについてMP2/6-31G^*及びMP2/aug-cc-pVDZ理論レベルで例示する。

シソーラス用語： *生体高分子 ,  BSSE ,  モデリング ,  数学モデル ,  *フラグメント ,  分子間相互作用 ,  基底関数系 ,  タンパク質 ,  分子化合物 ,  シス-トランスイソメラーゼ ,  *電子構造
準シソーラス用語： Pin1蛋白質 ,  基底関数重合せ誤差 ,  線形モデル ,  分子錯体

分類 (3件)： 蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N) ,  ペプチド  (CF10080G) ,  分子の電子構造  (BH05010Q)

タイトルに関連する用語 (4件)： 生体分子 ,  基底関数重ね合せ誤差 ,  統計 ,  モデル