文献

J-GLOBAL ID：201202206658386764   整理番号：12A0770804

大腸菌K12における相同核様体関連蛋白質IHFおよびHUによるDNA結合および遺伝子調節のゲノム解析

Genomic analysis of DNA binding and gene regulation by homologous nucleoid-associated proteins IHF and HU in Escherichia coli K12

著者 (11件)： PRIETO Ana I. (Univ. Cambridge, Cambridge) ,  PRIETO Ana I. (EMBL-European Bioinformatics Inst., Cambridge) ,  KAHRAMANOGLOU Christina (Univ. Cambridge, Cambridge) ,  KAHRAMANOGLOU Christina (National Inst. for Medical Res., London, GBR) ,  ALI Ruhi M. (EMBL-European Bioinformatics Inst., Cambridge) ,  ALI Ruhi M. (Anna Univ., Chennai) ,  FRASER Gillian M. (Univ. Cambridge, Cambridge) ,  SESHASAYEE Aswin S. N. (EMBL-European Bioinformatics Inst., Cambridge) ,  SESHASAYEE Aswin S. N. (National Centre for Biological Sci., Bangalore, IND) ,  LUSCOMBE Nicholas M. (EMBL-European Bioinformatics Inst., Cambridge) ,  LUSCOMBE Nicholas M. (Okinawa Inst. of Sci. and Technol., Okinawa, JPN)
資料名： Nucleic Acids Research  (Nucleic Acids Research)
巻： 40  号： 8  ページ： 3524-3537  発行年： 2012年04月30日 
JST資料番号： D0242C  ISSN： 0305-1048  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本報告では,ChIP-seq法を用いて,大腸菌K12染色体へのIHFおよびHU結合のゲノムスケール研究を示した。また,各蛋白質の単一および二重欠失突然変異体における遺伝子発現のマイクロアレイ解析を行い,そのレギュロンを同定した。IHFの配列特異性プロファイルは全てのオペロンの~30%を含んだが,その欠失によりこれらの<10%の発現が影響され,組み合わせ制御または分子的バックアップを示唆していた。しかし,HUに対する結合プロファイルは,A/TリッチDNAに対し選好を持つ染色体への非特異性結合を反映している。

シソーラス用語： *大腸菌 ,  核様体 ,  *組込宿主因子 ,  *DNA結合タンパク質 ,  結合 ,  *DNA【核酸】 ,  *遺伝的調節 ,  遺伝学 ,  免疫沈降反応 ,  染色体 ,  ゲノム ,  突然変異体 ,  遺伝子発現 ,  DNAマイクロアレイ ,  レギュロン ,  オペロン
準シソーラス用語： ChIP-seq法 ,  DNA結合 ,  *HU蛋白質 ,  *IHF ,  ゲノム解析 ,  マイクロアレイ解析 ,  *遺伝子調節 ,  *大腸菌K12

分類 (6件)： 微生物の生化学  (EG03020N) ,  蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N) ,  核酸一般  (EB04010U) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  遺伝的変異  (EC01030Y)

タイトルに関連する用語 (8件)： 大腸菌K12 ,  核様体 ,  蛋白質 ,  IHF ,  HU ,  DNA結合 ,  遺伝子調節 ,  ゲノム解析