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J-GLOBAL ID:201202207234002040   整理番号:12A1357413

系統的及び階層型クラスタリング木の評価用の計算ツール

Computational Tools for Evaluating Phylogenetic and Hierarchical Clustering Trees
著者 (2件):
資料名:
巻: 21  号:ページ: 581-599  発行年: 2012年09月 
JST資料番号: W2313A  ISSN: 1061-8600  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: アメリカ合衆国 (USA)  言語: 英語 (EN)
抄録/ポイント:
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進化の研究において根あり二分木が使われる一方,マイクロアレイデータに対して階層型クラスタリング木は最も一般的な表示である。本論文において,筆者らは系統木及び階層型クラスタリング表示の評価の問題を共通の数学的フレームワーク内で組み合わせた。木空間幾何学は木幾何学とEuclid幾何学との間の何処かに存在するので,筆者らが開発した2つの手法は木の集合の補足的見解を提供する。筆者らはBayes事後確率サンプリングあるいはブートストラップ法による出力として木の分布の評価における単純な応用を示した。MDS(多次元スケーリング)によって提供されるEuclid近似に関した測度空間に根あり二分木を埋込む事によって,線形判別分析からk-平均クラスタリングまでの多変量統計学における全ての現存する手法を利用できる。
シソーラス用語:
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分類 (2件):
分類
JSTが定めた文献の分類名称とコードです
統計学  ,  幾何学 

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