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J-GLOBAL ID：201202207264397104   整理番号：12A1158508

倍数体植物類における候補遺伝子類のコスト効率の良いツーオーダー多重シーケンシングのための尾付きPCR操作

A tailed PCR procedure for cost-effective, two-order multiplex sequencing of candidate genes in polyploid plants

著者 (4件)： GHOLAMI Mahmood (Justus Liebig Univ., Giessen, DEU) ,  BEKELE Wubishet A. (Justus Liebig Univ., Giessen, DEU) ,  SCHONDELMAIER Joerg (Saaten-Union Biotec GmbH, Leopoldshoehe, DEU) ,  SNOWDON Rod J. (Justus Liebig Univ., Giessen, DEU)
資料名： Plant Biotechnology Journal  (Plant Biotechnology Journal)
巻： 10  号： 6  ページ： 635-645  発行年： 2012年08月 
JST資料番号： W1741A  ISSN： 1467-7644  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： モデル植物において詳細な前/逆遺伝学によって発見された候補遺伝子類は,多くの主要作物種における重要な特性改善のための貴重な資源である。与えられた標的遺伝子類の多重相同体類に同時にアドレスできる遺伝子特異的PCRアンプリコン類にける多重化した454のシーケンシングのための方法を示した。多数の標的遺伝子アンプリコン類のコスト効率の良い増幅が可能な一組のバーコード化したM13/T7汎用性融合プライマー類を採用した単純な2段階のPCR操作を考案した。多重遺伝子型由来の多重アンプリコン類から成るプールにおいて同時にシーケンシングできるアンプリコン類を生成した。この高度なシーケンシングは,多重相同遺伝子座を表すコンティグ類に対する配列の読みの解決を可能にした。ケーススタデイを用いて,九つの遺伝子の組を種子発育と油脂含量制御の候補として,Brassica napusの複雑な倍数体ゲノムにおけるこの操作をテストした結果,これら遺伝子類の6コピーまではB.napusに期待できた。

シソーラス用語： *PCR法 ,  植物 ,  *倍数体 ,  *遺伝学実験技術 ,  遺伝子 ,  *多重化 ,  最適制御 ,  アブラナ属 ,  ゲノム
準シソーラス用語： Brassica napus ,  アンプリコン ,  コスト最適制御 ,  *シーケンス解析

分類 (3件)： 植物学一般  (EH01010R) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  生物科学研究法一般  (EA03010K)

タイトルに関連する用語 (7件)： 倍数体 ,  植物類 ,  候補遺伝子 ,  コスト効率 ,  多重 ,  尾 ,  PCR