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J-GLOBAL ID：201202208013277505   整理番号：12A0783712

地理的に異なる土壌ミクロビオームの天然産物生合成遺伝子の多様性

Natural Product Biosynthetic Gene Diversity in Geographically Distinct Soil Microbiomes

著者 (6件)： REDDY Boojala Vijay B. (Rockefeller Univ., New York, USA) ,  KALLIFIDAS Dimitris (Rockefeller Univ., New York, USA) ,  KIM Jeffrey H. (Rockefeller Univ., New York, USA) ,  CHARLOP-POWERS Zachary (Rockefeller Univ., New York, USA) ,  FENG Zhiyang (Rockefeller Univ., New York, USA) ,  BRADY Sean F. (Rockefeller Univ., New York, USA)
資料名： Applied and Environmental Microbiology  (Applied and Environmental Microbiology)
巻： 78  号： 10  ページ： 3744-3752  発行年： 2012年05月 
JST資料番号： A0427A  ISSN： 0099-2240  CODEN： AEMIDF  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 地球上に存在すると推定される細菌種の数は近年劇的に増加し,細菌天然物生合成遺伝子多様性も以前培養により得たものは有意に過小評価されていた可能性が出てきた。3種の異なる環境土壌から分離したDNAを用い構築したコスミドライブラリーから,454個のピロシークエンスした非リボソーム性ペプチドアデニル化ドメイン,タイプIポリケチドケトシンターゼドメイン,タイプIIポリケチドケトシンターゼα遺伝子断片を比較解析した。16S rRNA遺伝子配列の解析で,これらクローン化メタゲノムは主要な細菌門の類似分布からのDNAを含み,メタゲノムは特異的な二次代謝産物生合成遺伝子配列コレクションを含むことを示した。85%同一性でグループ化すると,アデニル化ドメインの1.5%,ケトシンターゼの1.2%,ケトシンターゼα配列クラスターの9.3%のみがこの3種のメタゲノムからの配列を含んでいた。原核生物の天然物生合成多様性は細菌種多様性と同様,培養研究に基づくものより潜在的に遙かに大きいことを示唆した。

シソーラス用語： *細菌 ,  *生物多様性 ,  DNA【核酸】 ,  遺伝学実験技術 ,  コスミド ,  *複合酵素系 ,  rRNA遺伝子 ,  クラスタ ,  *土壌細菌 ,  遺伝学 ,  *二次代謝産物 ,  生合成 ,  相同性 ,  原核生物 ,  地理的分布 ,  系統樹 ,  生物分類 ,  *遺伝子導入 ,  化学反応
準シソーラス用語： 16S rRNA遺伝子 ,  アデニル化 ,  ピロシークエンス法 ,  *ポリケチドシンターゼ ,  ミクロビオーム ,  メタゲノム解析 ,  遺伝子クラスタ ,  *遺伝子デリバリー ,  *遺伝子多様性 ,  系統解析 ,  *生合成経路 ,  分子系統樹

分類 (2件)： 微生物の生態  (EG03040J) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (6件)： 地理 ,  土壌 ,  ミクロビオーム ,  天然産物 ,  生合成遺伝子 ,  多様性