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J-GLOBAL ID：201202208574281536   整理番号：12A0715242

計算機設計を通したOmpF蛋白質の工学作成オリゴマ化状態は,非折畳みからオリゴマ解離を切り離す

Engineered Oligomerization State of OmpF Protein through Computational Design Decouples Oligomer Dissociation from Unfolding

著者 (7件)： NAVEED Hammad (Dep. of Bioengineering, Univ. of Illinois at Chicago, Chicago, IL 60607, USA) ,  JIMENEZ-MORALES David (Dep. of Bioengineering, Univ. of Illinois at Chicago, Chicago, IL 60607, USA) ,  TIAN Jun (Dep. of Bioengineering, Univ. of Illinois at Chicago, Chicago, IL 60607, USA) ,  PASUPULETI Volga (Dep. of Bioengineering, Univ. of Illinois at Chicago, Chicago, IL 60607, USA) ,  KENNEY Linda J. (Dep. of Microbiology and Immunology, Univ. of Illinois at Chicago, Chicago, IL 60612, USA) ,  KENNEY Linda J. (Mechanobiology Inst., National Univ. of Singapore, Singapore 117411, SGP) ,  LIANG Jie (Dep. of Bioengineering, Univ. of Illinois at Chicago, Chicago, IL 60607, USA)
資料名： Journal of Molecular Biology  (Journal of Molecular Biology)
巻： 419  号： 1-2  ページ： 89-101  発行年： 2012年05月25日 
JST資料番号： D0124B  ISSN： 0022-2836  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： この研究において,進化解析と連結した実験的エネルギー機能を用いて,三量体ポリンの外膜蛋白質F(OmpF)の鎖間の蛋白質-蛋白質相互作用(PPI)界面に顕著に寄与する残基を同定した。天然細菌外膜蛋白質において発生しないエネルギー的に有利な残基または置換による部位特異的変異誘発を通したこれらの残基の置換により,三量体オリゴマ状態の代わりに二量体及び単量体オリゴマ化状態を伴う工学的OmpF変異体作成に成功した。さらに,結果から,OmpFオリゴマ化は広範囲のPPI界面の2つの異なる領域を含む一連の相互作用を通して進行することを示唆した。すなわち,2つの単量体は相互作用し,PPI界面近傍のG19を通して二量体を形成した。次いで,この二量体はPPI界面近傍のG135を通してもう1つの単量体と相互作用し,三量体を形成した。PPI近傍のG19の摂動は単量体OmpFのみを形成することを見出した。設計した二量体OmpF変異体の熱変性により,オリゴマ解離は蛋白質折畳みの過程から分かれることを示唆した。さらに,保存部位近傍のG57及びG59はPPI界面に重要であり,PPIの必須足場をもたらすらしい。Copyright 2012 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： *外膜タンパク質 ,  *オリゴマ化 ,  分子間相互作用 ,  アミノ酸残基 ,  部位特異的変異誘発 ,  塩基対置換 ,  三量体 ,  二量体 ,  単量体 ,  突然変異体 ,  熱変性 ,  折畳み構造 ,  オリゴマ ,  計算機シミュレーション ,  ポリン
準シソーラス用語： アミノ酸置換 ,  蛋白質折畳み ,  蛋白質-蛋白質相互作用 ,  *OmpF

分類 (1件)： 蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N)

タイトルに関連する用語 (7件)： 計算機設計 ,  OmpF蛋白質 ,  工学 ,  オリゴマ化 ,  非折畳み ,  オリゴマ ,  解離