孔辺細胞生理学の定量的動力学的なモデリングのためのコンピュータープラットホームOnGuard

HILLS Adrian; CHEN Zhong-Hua; AMTMANN Anna; BLATT Michael R.; LEW Virgilio L.

文献

J-GLOBAL ID：201202210442925528 整理番号：12A1093705

孔辺細胞生理学の定量的動力学的なモデリングのためのコンピュータープラットホームOnGuard

OnGuard, a Computational Platform for Quantitative Kinetic Modeling of Guard Cell Physiology

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資料名：
巻： 159 号： 3 ページ： 1026-1042 発行年： 2012年07月
JST資料番号： C0606A ISSN： 0032-0889 CODEN： PLPHA 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

気孔孔辺細胞は植物葉の表皮の孔を囲み孔の開口を制御している。孔辺細胞についての輸送,シグナル伝達およびホメオスタシスのために利用可能な生物物理学的および動力学的知識の積み上げによって,孔辺細胞のためのコンピューターモデルを構築した。細胞膜や液胞膜,オスモライト代謝およびサイトゾルフリーのCa²⁺濃度やpHの主要な制御における輸送体類の基本的な特性のすべてを取り込むために,HoTSigライブラリーを用いてOnGuardソフトウェアを構築した。このライブラリーは計算要素類を段々に並べ相関付けする構造化手法を生じさせ,OnGuardソフトウェアはパラメーター類や方程式類への容易なアクセスを可能にした。OnGuardモデルが生理学的に分別できるベースラインあるいは基準状態の安定性を容易に達成できることを示し,また液胞膜や細胞膜における環境パラメーターの変化および輸送体類の主要なグループの活性を調整する場合におけるこれら基準状態のロバスト性を示した。

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植物学一般 , 細胞生理一般 , 情報処理一般

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