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J-GLOBAL ID：201202211053589772   整理番号：12A1093983

多サブユニット蛋白質における速度論的に接近可能トンネルを介するガス拡散の効果的シミュレーション:T-状態デオキシヘモグロビンにおけるO₂経路および逃避ルート

Effective Simulations of Gas Diffusion Through Kinetically Accessible Tunnels in Multisubunit Proteins: O₂ Pathways and Escape Routes in T-state Deoxyhemoglobin

著者 (3件)： SHADRINA Maria S. (Concordia Univ., Quebec, CAN) ,  ENGLISH Ann M. (Concordia Univ., Quebec, CAN) ,  PESLHERBE Gilles H. (Concordia Univ., Quebec, CAN)
資料名： Journal of the American Chemical Society  (Journal of the American Chemical Society)
巻： 134  号： 27  ページ： 11177-11184  発行年： 2012年07月11日 
JST資料番号： C0254A  ISSN： 0002-7863  CODEN： JACSAT  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 蛋白質マトリックス内の特定結合部位へのガス(O₂,CO,NO,H₂)拡散は,蛋白質の生化学的特異性および反応性にとって極めて重要である。本研究では一例として,ヒトヘモグロビン(HbA)におけるO₂拡散を,最近開発された’温度制御性局所増強性サンプリング’(TLES)法を利用して調べた。この方法は,標準分子動特性(MID)に対して慎重に有効化されることから,T-状態デオキシHbAへのリガンド拡散に関する実験構造データおよび速度論データを得ることができる。T-状態デオキシHbAの場合,α-およびβ-サブユニットにおいて実験的に観察されたXe窪みと合致する明白なリガンド拡散トンネルが見出された。更に,ヘムへの接近を制御する遠位ヒスチジン(E7)など2つの遠位障壁が同定された。また,シミュレーションによって明らかとなった多重逃避ルートについても述べた。

シソーラス用語： *デオキシヘモグロビン ,  酸素 ,  サブユニット ,  ポテンシャル障壁 ,  ヒト ,  トンネル
準シソーラス用語： ガス拡散

分類 (1件)： 分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (10件)： サブユニット蛋白質 ,  速度論 ,  接近 ,  トンネル ,  ガス拡散 ,  シミュレーション ,  デオキシヘモグロビン ,  O2 ,  経路 ,  逃避