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J-GLOBAL ID：201202211556448742   整理番号：11A1734414

アデノシンA_1受容体のホモロジーモデリングと構造検証

Homology Modeling and Structure Validation of the Adenosine A_1 Receptor

著者 (4件)： Ke Yanrong (State Key Lab. of Natural and Biomimetic Drugs, School of Pharmaceutical Sciences, Health Sci. Center, Peking Univ. ...) ,  Jin Hongwei (State Key Lab. of Natural and Biomimetic Drugs, School of Pharmaceutical Sciences, Health Sci. Center, Peking Univ. ...) ,  Liu Zhenming (State Key Lab. of Natural and Biomimetic Drugs, School of Pharmaceutical Sciences, Health Sci. Center, Peking Univ. ...) ,  Zhang Liangren (State Key Lab. of Natural and Biomimetic Drugs, School of Pharmaceutical Sciences, Health Sci. Center, Peking Univ. ...)
資料名： Wuli Huaxue Xuebao  (Wuli Huaxue Xuebao)
巻： 26  号： 10  ページ： 2833-2839  発行年： 2010年 
JST資料番号： W0391A  ISSN： 1000-6818  CODEN： WHXUEU  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： アデノシンA_1受容体の3次元構造モデルをホモロジーモデリングにより構築した。受容体-リガンド複合体を作るためにアンタゴニストDPCPXをモデル蛋白質にドッキングさせた,複合体に対する分子動力学シミュレーションを5ns間行ない,シミュレーションの最後の2nsから得た平均構造と調査平衡後に抽出した11フレームを含む12種の蛋白質構造を選択した。次いで,DOCK,VINA及びGOLDソフトウエアパッケージを用いて52種の活性アンタゴニストと1000種のデコイからなるデータベースを12種の蛋白質モデルにドッキングさせてこれらの分子をドッキングスコアによりランクづけした。更に,最高濃縮係数(EF)とROC下で最大面積(AU-ROC)をもつ最良のモデル蛋白質を選定した。10%のランキングデータベースでの濃縮係数とAU-ROC計算による結果から,GOLDがアデノシンA_1受容体に対する最良のバ-チャルスクリ-ニングソフトウエアであった。GOLDでのドッキング結果から,最適化アデノシンA_1受容体蛋白質構造のFavg及びF5はバ-チャルスクリ-ニング用とより強力なアンタゴニスト開発用に利用できると見なせた。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST

シソーラス用語： *A1受容体 ,  分子モデル ,  分子構造 ,  構造 ,  計算機シミュレーション ,  プログラムパッケージ ,  データベース ,  薬物 ,  係数
準シソーラス用語： *アデノシンA1受容体 ,  ホモロジーモデリング ,  三次元構造 ,  分子動力学シミュレーション ,  ソフトウェアパッケージ ,  蛋白質構造 ,  アンタゴニスト ,  濃縮係数

分類 (1件)： 細胞膜の受容体  (EF04030C)

タイトルに関連する用語 (4件)： アデノシン ,  受容体 ,  ホモロジーモデリング ,  検証