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J-GLOBAL ID：201202213568639988   整理番号：12A0809218

捉えにくい短い遺伝子 原核生物ゲノム認識に対するアンサンブル法

The elusive short gene - an ensemble method for recognition for prokaryotic genome

著者 (2件)： GOLI Baharak (Dep. of Computational Biology and Bioinformatics, Univ. of Kerala, Trivandrum 695581, IND) ,  NAIR Achuthsankar S. (Dep. of Computational Biology and Bioinformatics, Univ. of Kerala, Trivandrum 695581, IND)
資料名： Biochemical and Biophysical Research Communications  (Biochemical and Biophysical Research Communications)
巻： 422  号： 1  ページ： 36-41  発行年： 2012年05月25日 
JST資料番号： B0118A  ISSN： 0006-291X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ゲノム配列情報から,短い蛋白質をコードするDNAの正確な予想は,DNA配列分析での未解決の問題である。人気のある遺伝子発見ツールは,我々が短いと定義する,400nt以下の遺伝子を予想する場合,正確性が著しく低下する。この研究では,原核生物ゲノムにおける短い遺伝子の認識での弁別力に関し,選別したコード測定単位のセットを定量的に評価した。迅速な相関に基づく特徴選別(FCBF)法により,高い弁別力でコードの測定単位のサブセットを同定した。このように同定した測定単位を持ち,短い遺伝子認識に対する新しい方法を示した。基本分類としてランダムフォレストと組み合わせAdaBoost.M1を用いた短い遺伝子予想は,短い遺伝子に対し,92.74%の正確性,94.77%の感度および90.06%の特異性を示した。Copyright 2012 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： 計算機アルゴリズム ,  原核生物 ,  *解析 ,  *予測技法 ,  *同定 ,  性質 ,  感度 ,  能力
準シソーラス用語： ランダムフォレスト ,  *コンピュータ解析 ,  遺伝子分析 ,  *遺伝子同定 ,  正確性 ,  検出感度

分類 (2件)： 遺伝学研究法  (EC01020N) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (4件)： 遺伝子 ,  原核生物 ,  ゲノム ,  アンサンブル法