アンギオテンシン変換酵素阻害ジペプチドの予測モデリング

NORRIS Roseanne; CASEY Fergal; CASEY Fergal; FITZGERALD Richard J.; FITZGERALD Richard J.; SHIELDS Denis; SHIELDS Denis; MOONEY Catherine; MOONEY Catherine

文献

J-GLOBAL ID：201202214130493340 整理番号：12A0653770

アンギオテンシン変換酵素阻害ジペプチドの予測モデリング

Predictive modelling of angiotensin converting enzyme inhibitory dipeptides

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資料名：
巻： 133 号： 4 ページ： 1349-1354 発行年： 2012年08月15日
JST資料番号： H0766A ISSN： 0308-8146 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：イギリス (GBR) 言語：英語 (EN)

AutoDock Vinaを使用してアンギオテンシン変換酵素(ACE)阻害ジペプチド配列を推定するドッキングの能力を評価した。全潜在的ジペプチドおよびリン-ジペプチドを短く切り,評価した。ペプチドの腸安定性を推定アミノ酸クラスタリングモデルを用いて評価した。AutoDock Vinaスコアが≦-8.1であり,腸で’安定’と推定されたジペプチドを選択し,LIGPLOTおよびACE阻害能を使用してキャラクタリゼーションした。2種の新しく同定したACE阻害ジペプチド,Vinaスコアが-8.3および-8.6であるAsp-TrpおよびTrp-Proは,それぞれ258±4.23および217±15.7μMのIC₅₀値を呈した。LIGPLOT分析から,これらのジペプチドに対する亜鉛の相互作用は無い事が分かった。リン-ジペプチドはACEに対する親和性が良いと推定された。しかし実験的に確認したIC₅₀の結果は相関せず,例えばVinaスコアが-8.5および-8.1のTrp-pThrおよびPro-pTyrはそれぞれ>500μMのIC₅₀値を呈した。ドッキングにより新しいACE阻害ジペプチドの同定ができたが,これは必ずしも全事例で完全な推定手段では無い。Copyright 2012 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.

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生理活性ペプチド

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