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J-GLOBAL ID：201202214281174778   整理番号：12A0735972

Bowtie2による高速ギャップリードアラインメント

Fast gapped-read alignment with Bowtie 2

著者 (5件)： LANGMEAD Ben (Univ. Maryland, Maryland, USA) ,  LANGMEAD Ben (Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health, Maryland, USA) ,  SALZBERG Steven L (Univ. Maryland, Maryland, USA) ,  SALZBERG Steven L (Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health, Maryland, USA) ,  SALZBERG Steven L (Johns Hopkins Univ. School of Medicine, Maryland, USA)
資料名： Nature Methods  (Nature Methods)
巻： 9  号： 4  ページ： 357-359  発行年： 2012年04月 
JST資料番号： W1413A  ISSN： 1548-7091  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： フルテキストミニットインデックスとハードウェア促進動的プログラミングアルゴリズムを組み合わせて,配列アライメントを行うBowtie2の性能を,他の3種のリードアライナーと比較して評価した。その結果,Bowtie2は,高速,高感度,正確であり,シークエンシング作業に適していることが分かった。Bowtie2は,フリー,オプンソースソフトウェアとして利用できる。

シソーラス用語： *遺伝学実験技術 ,  *アルゴリズム ,  ゲノム ,  データ解析 ,  *ヌクレオチド配列 ,  *ソフトウェア ,  ヒトゲノム ,  *配列アライメント ,  ゲノム配列
準シソーラス用語： ゲノムシークエンス ,  *Bowtie2システム

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)