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J-GLOBAL ID：201202216413557437   整理番号：12A0962047

Methylocystis sp.SC2株に由来する,メタノトロフ特異的repABCを含む2種類のプラスミドの完全配列解析

Complete Sequence Analysis of Two Methanotroph-Specific repABC-Containing Plasmids from Methylocystis sp. Strain SC2

著者 (6件)： DAM Bomba (Max Planck Inst. Terrestrial Microbiology, Marburg, DEU) ,  KUBE Michael (Max Planck Inst. Molecular Genetics, Berlin, DEU) ,  KUBE Michael (Humboldt-Univ. Berlin, Berlin, DEU) ,  DAM Somasri (Max Planck Inst. Terrestrial Microbiology, Marburg, DEU) ,  REINHARDT Richard (Max Planck Inst. Molecular Genetics, Berlin, DEU) ,  LIESACK Werner (Max Planck Inst. Terrestrial Microbiology, Marburg, DEU)
資料名： Applied and Environmental Microbiology  (Applied and Environmental Microbiology)
巻： 78  号： 12  ページ： 4373-4379  発行年： 2012年06月 
JST資料番号： A0427A  ISSN： 0099-2240  CODEN： AEMIDF  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Methylocystis sp.SC2のゲノム配列を決定する過程で,2種類の新規なプラスミドの完全配列を取得した。すなわち,GC含量60.7mol%の229.6kbプラスミド(pBSC2-1)と,GC含量60.4mol%の143.5kbプラスミド(pBSC2-2)である。これらのプラスミドはいずれも1コピープラスミドと推察でき,PFGE解析とSouthernブロット解析からその実存を確認できた。pBSC2-1は240,pBSC2-2は152の予想ORFを含み,いずれのプラスミドもrepABC複製モジュールを有していた。pBSC2-1には重金属耐性遺伝子と銅輸送遺伝子が存在し,pBSC2-2はpmoCシングルトンを有していた。これらの知見について考察した。

シソーラス用語： *Methylomonas ,  メチロトローフ ,  プラスミド ,  コピー数 ,  ヌクレオチド配列 ,  遺伝子地図 ,  解析 ,  系統樹 ,  生物分類
準シソーラス用語： *Methylocystis ,  系統関係 ,  分子系統解析 ,  分子系統樹

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (5件)： Methylocystis ,  株 ,  メタノトロフ ,  プラスミド ,  配列解析