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J-GLOBAL ID：201202218114007121   整理番号：12A0340339

CAMERA: 液体クロマトグラフィー/質量分析データセットの化合物スペクトル抽出および注釈のための統合戦略

CAMERA: An Integrated Strategy for Compound Spectra Extraction and Annotation of Liquid Chromatography/Mass Spectrometry Data Sets

著者 (5件)： KUHL Carsten (Leibniz Inst. of Plant Biochemistry, Saale, DEU) ,  TAUTENHAHN Ralf (Scripps Res. Inst., California, USA) ,  BOETTCHER Christoph (Leibniz Inst. of Plant Biochemistry, Saale, DEU) ,  LARSON Tony R. (Univ. York, GBR) ,  NEUMANN Steffen (Leibniz Inst. of Plant Biochemistry, Saale, DEU)
資料名： Analytical Chemistry  (Analytical Chemistry)
巻： 84  号： 1  ページ： 283-289  発行年： 2012年01月03日 
JST資料番号： A0395A  ISSN： 0003-2700  CODEN： ANCHAM  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： LC-MS分析は日常的に広くメタボロミクス実験に使用されている。データ取得の段階と異なり,化合物の注釈と同定には膨大な解析が必要で,データ解釈の障害となっている。ここでは化合物スペクトルの抽出,同位体注釈,付加物ピークを統合するアルゴリズムのBioconductorパッケージであるCAMERAを提案した。濃度が異なる複雑なマトリックスへ既知の混合化合物を加え,手動で定めた注釈とCAMERAによる注釈を比較した。CAMERAは注釈可能な化合物の89.7%および90.3%について正確な質量を抽出した。さらに,注釈の改善に正負イオンモードを変えたデータ取得の新規注釈法を提案した。

シソーラス用語： *LC-MS分析 ,  解析 ,  データ解析 ,  抽出 ,  同位体存在比 ,  モード変換 ,  *プログラムパッケージ
準シソーラス用語： データ抽出 ,  *パッケージソフト ,  メタボロミクス

分類 (2件)： 有機化合物の各種分析  (CC08034J) ,  数値計算  (JE02000J)

タイトルに関連する用語 (7件)： 液体クロマトグラフィー ,  質量分析 ,  データセット ,  スペクトル ,  注釈 ,  統合 ,  戦略