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J-GLOBAL ID：201202218553026027   整理番号：12A1347844

ビリンヘッドピースのC末端サブドメインにおけるCH・・・π相互作用の強度

Strength of CH...π Interactions in the C-Terminal Subdomain of Villin Headpiece

著者 (2件)： KANG Young Kee (Chungbuk National Univ., Chungbuk, KOR) ,  BYUN Byung Jin (Chungbuk National Univ., Chungbuk, KOR)
資料名： Biopolymers  (Biopolymers)
巻： 97  号： 10  ページ： 778-788  発行年： 2012年10月 
JST資料番号： C0766A  ISSN： 0006-3525  CODEN： BIPMAA  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ビリンヘッドピースのC末端サブドメインにおけるCH・・・π相互作用の相対強度を評価するために,密度汎関数法を用いて7種類のモデルペプチドPLX(X=W,Y,F,HあるいはA)およびALX(X=WあるいはA)の折畳み構造の相対自由エネルギーを測定した。PLW,PLY,PLFおよびPLHペプチドのPro・・・πでは,蛋白質における機能的に重要なPro残基における相互作用と同様に,Pro環の端が芳香環の表面と相互作用していた。折畳み構造の相対的安定性はPLW>ALW>PLA>PLH>PLY>ALA>PLFの順番であり,これはC末端サブドメインの野生型および変異型に対する円二色性熱解析の結果とも一致した。最も安定なPLWはProおよびTrpの間の合計結合エネルギーの約40%がCH・・・π相互作用であった。PLWとALWを比較したとき分散エネルギーに大きな違いがあることが分かった。

シソーラス用語： *分子内相互作用 ,  *アクチン結合タンパク質 ,  密度汎関数法 ,  折畳み構造 ,  Gibbs自由エネルギー ,  モデル化合物 ,  アミノ酸配列 ,  エネルギー ,  円偏光二色スペクトル ,  熱分析 ,  結合エネルギー ,  ペプチド
準シソーラス用語： CH・・・π相互作用 ,  C末端ドメイン ,  *ビリン ,  分散エネルギー

分類 (1件)： 蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N)

タイトルに関連する用語 (5件)： C末端 ,  サブ ,  ドメイン ,  CH ,  π相互作用