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J-GLOBAL ID：201202221037307568   整理番号：12A0625392

pHとD-ペプチドが影響を及ぼした通りのアミロイドβペプチドAβ_1~40とAβ_1~42の構造

Structures of the Amyloid β-Peptides Aβ_1-40 and Aβ_1-42 as Influenced by pH and a D-Peptide

著者 (4件)： OLUBIYI Olujide O. (Res. Centre Juelich, DEU) ,  STRODEL Birgit (Res. Centre Juelich, DEU) ,  OLUBIYI Olujide O. (German Res. School for Simulation Sci. GmbH, Juelich, DEU) ,  STRODEL Birgit (Heinrich Heine Univ. Duesseldorf, Duesseldorf, DEU)
資料名： Journal of Physical Chemistry B  (Journal of Physical Chemistry B)
巻： 116  号： 10  ページ： 3280-3291  発行年： 2012年03月15日 
JST資料番号： W0921A  ISSN： 1520-6106  CODEN： JPCBFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Alzheimer病に関係するペプチド,アミロイドβペプチドAβ_1~40とAβ_1~42の二次構造を比較した。ms時間規模で二種類のGROMOS98力の場ffG43a2とff53a6を用い,分子動力学(MD)シミュレーションを行った。MDトラジェクトリーから計算したNMR化学シフト面で特性化し,対応する実験NMR結果に対して検証したAβ_1~40とAβ_1~42のサンプリング立体配座のペプチドと力の場の関連差を観察した。この解析から,Aβ_1~40とAβ_1~42の構造性癖をff53a6がff43a2よりも優れてモデル化できることを結論付けた。更に,実証した抗アミロイド効果を有するD3,12残基高濃度アルギニンD-エナンチオマペプチドのpHと結合がAβ_1~42構造に及ぼす影響記述を提供した。若干酸性条件のもとで,Aβ_1~42の三個のヒスチジン残基のプロトン化が二個の末端領域間の静電斥力縮減を経由してβシート生成を促進することを実証した。本研究はD3とAβ_1~42間の結合が負荷電Aβ_1~42残基とD3の5個の正荷電アルギニン残基間の静電相互作用によって駆動されることも実証した。D3結合がアミロイドペプチド中大きな立体配座変化を誘起することを見いだした。この変化はDペプチドの観測したアミロイド阻害性質を記録し,恐らく説明する最も顕著な効果であるβシート単位の縮減を伴った。

シソーラス用語： *アミロイドβタンパク質 ,  pH依存性 ,  *オリゴペプチド ,  アミノ酸配列 ,  *アミノ酸残基 ,  Alzheimer病 ,  立体配座 ,  β構造 ,  *配座転移 ,  構造特性 ,  静電相互作用 ,  斥力 ,  標本抽出 ,  エナンチオマ ,  化学シフト ,  経時変化 ,  時間依存性 ,  力の場 ,  分子動力学 ,  計算機シミュレーション ,  プロトン化 ,  トラジェクトリー
準シソーラス用語： βシート ,  アミロイドβペプチド ,  サンプリング【統計】 ,  構造性質 ,  時間規模 ,  分子動力学シミュレーション ,  立体配座変化 ,  ペプチド立体配座

分類 (2件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  神経の基礎医学  (GN01020W)

タイトルに関連する用語 (4件)： pH ,  ペプチド ,  通り ,  アミロイドβペプチド