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J-GLOBAL ID：201202222496045750   整理番号：12A1660196

PDE法に基づいたゼブラフィッシ体節の自動定量化

Automated quantification of zebrafish somites based on PDE method

著者 (6件)： LU J. (Nanjing Univ. Sci. and Technol., Nanjing, CHN) ,  WU T. (Nanjing Univ. Sci. and Technol., Nanjing, CHN) ,  LIU T. (Univ. Georgia, Georgia, USA) ,  CHEN C. (Nanjing Univ. Sci. and Technol., Nanjing, CHN) ,  ZHAO C. (Nanjing Univ. Sci. and Technol., Nanjing, CHN) ,  YANG J. (Nanjing Univ. Sci. and Technol., Nanjing, CHN)
資料名： Journal of Microscopy  (Journal of Microscopy)
巻： 248  号： 2  ページ： 156-162  発行年： 2012年11月 
JST資料番号： B0454B  ISSN： 0022-2720  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ゼブラフィッシの体節の検出の目的は,成長のバイオマーカーとして,ゼブラフィッシ胚発生の間の,体節の数をコンピュータで計数するためである。これは,ゼブラフィッシュの定量的表現型と創薬における重要なアプリケーションがある。ここでは,変微分(PDE)法を用い,この問題を解決した。この方法の主な流れは,はじめに,本体を,レベルセット法を用いて分割する。次に,頭部を除いて,この手法への悪影響を低減する。その後,胴体を整列し,コヒーレンス強化フィルタ処理を行い,体節検出を容易にする。最後に,体節が容易に抽出される。暫定的な実験結果は,このアルゴリズムがうまく機能することを示した。

シソーラス用語： *ゼブラフィッシュ ,  *体節 ,  定量分析 ,  成長 ,  バイオマーカー ,  胚発生 ,  表現型 ,  製品開発 ,  数値解法 ,  顕微鏡観察
準シソーラス用語： レベルセット法 ,  *自動定量 ,  創薬

分類 (3件)： 遺伝的変異  (EC01030Y) ,  パターン認識  (JE07000S) ,  生体の顕微鏡観察法  (EA03050C)

タイトルに関連する用語 (3件)： PDE ,  体節 ,  自動定量