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J-GLOBAL ID：201202223101146428   整理番号：12A1774113

変動する場の状況下でのトランスクリプトーム動態の解析と予測

Deciphering and Prediction of Transcriptome Dynamics under Fluctuating Field Conditions

著者 (9件)： NAGANO Atsushi J. (Photosynthesis and Photobiology Res. Unit, National Inst. of Agrobiological Sciences, 2-1-2 Kannondai, Tsukuba ...) ,  SATO Yutaka (Genome Resource Center, National Inst. of Agrobiological Sciences, 2-1-2 Kannondai, Tsukuba, Ibaraki 305-8602, JPN) ,  MIHARA Motohiro (Plant Genomics Res. Unit, National Inst. of Agrobiological Sciences, 2-1-2 Kannondai, Tsukuba, Ibaraki 305-8602, JPN) ,  ANTONIO Baltazar A. (Genome Resource Center, National Inst. of Agrobiological Sciences, 2-1-2 Kannondai, Tsukuba, Ibaraki 305-8602, JPN) ,  MOTOYAMA Ritsuko (Genome Resource Center, National Inst. of Agrobiological Sciences, 2-1-2 Kannondai, Tsukuba, Ibaraki 305-8602, JPN) ,  ITOH Hironori (Photosynthesis and Photobiology Res. Unit, National Inst. of Agrobiological Sciences, 2-1-2 Kannondai, Tsukuba ...) ,  NAGAMURA Yoshiaki (Genome Resource Center, National Inst. of Agrobiological Sciences, 2-1-2 Kannondai, Tsukuba, Ibaraki 305-8602, JPN) ,  IZAWA Takeshi (Photosynthesis and Photobiology Res. Unit, National Inst. of Agrobiological Sciences, 2-1-2 Kannondai, Tsukuba ...) ,  IZAWA Takeshi (Plant Genomics Res. Unit, National Inst. of Agrobiological Sciences, 2-1-2 Kannondai, Tsukuba, Ibaraki 305-8602, JPN)
資料名： Cell (Cambridge, Mass.)  (Cell (Cambridge, Mass.))
巻： 151  号： 6  ページ： 1358-1369  発行年： 2012年12月07日 
JST資料番号： A0707B  ISSN： 0092-8674  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 遺伝子発現パターンの推進力を決定することは,生物が生きている典型的な,複雑で変動する環境においてよりも,実験室条件の方がより確実である。著者らは対応する気象データとともに水田でのイネの葉からトランスクリプトームデータを収集し,これらを用いて遺伝子発現に及ぼす内在性の影響と外部要因についての統計モデルを開発した。トランスクリプトーム動態は内在性の日周リズム,気温,植物の齢,太陽放射により主に支配されていることを著者らの結果は示している。これらのデータは,転写に影響を与える環境刺激の日周ゲートを明らかにし,異なる代謝遺伝子に及ぼす日周期および環境因子により発揮される相対的な影響を指摘した。このモデルはまた,トランスクリプトーム動態に及ぼす温度変化の影響を予測した。著者らのモデルは,実験室で蓄積した知識を農業での問題に転換する手助けになると考えられ,複雑な環境下でのトランスクリプトームの変動を解読する著者らのアプローチは他の生物にも適応可能であると著者らは予測する。Copyright 2012 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： トランスクリプトーム ,  *イネ ,  *生息環境 ,  *遺伝子発現 ,  形質発現 ,  因子 ,  日周期 ,  太陽光 ,  種差 ,  地域差 ,  気候変動 ,  *mRNA発現 ,  環境因子 ,  シロイヌナズナ属 ,  *分子遺伝現象 ,  遺伝
準シソーラス用語： Arabidopsis

分類 (3件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  植物に対する影響  (EE04030Z) ,  発生,成長,分化  (EH02030U)

タイトルに関連する用語 (5件)： 場 ,  状況 ,  トランスクリプトーム ,  解析 ,  予測