文献

J-GLOBAL ID：201202223392343845   整理番号：12A1744513

オオムギゲノムの物理的,遺伝学的および機能的な配列組み立て

A physical, genetic and functional sequence assembly of the barley genome

著者 (40件)： MAYER Klaus F. X. (Helmholtz Zentrum Muenchen, Neuherberg, DEU) ,  NUSSBAUMER Thomas (Helmholtz Zentrum Muenchen, Neuherberg, DEU) ,  GUNDLACH Heidrun (Helmholtz Zentrum Muenchen, Neuherberg, DEU) ,  MARTIS Mihaela (Helmholtz Zentrum Muenchen, Neuherberg, DEU) ,  SPANNAGL Manuel (Helmholtz Zentrum Muenchen, Neuherberg, DEU) ,  PFEIFER Matthias (Helmholtz Zentrum Muenchen, Neuherberg, DEU) ,  WAUGH Robbie (James Hutton Inst., Dundee, GBR) ,  HEDLEY Pete (James Hutton Inst., Dundee, GBR) ,  LIU Hui (James Hutton Inst., Dundee, GBR) ,  MORRIS Jenny (James Hutton Inst., Dundee, GBR) ,  RUSSELL Joanne (James Hutton Inst., Dundee, GBR) ,  DRUKA Arnis (James Hutton Inst., Dundee, GBR) ,  MARSHALL David (James Hutton Inst., Dundee, GBR) ,  BAYER Micha (James Hutton Inst., Dundee, GBR) ,  BROWN John W. S. (James Hutton Inst., Dundee, GBR) ,  LANGRIDGE Peter (Univ. Adelaide, Glen Osmond, AUS) ,  SHI Bujun (Univ. Adelaide, Glen Osmond, AUS) ,  CLOSE Timothy J. (Univ. California, Riverside, California, USA) ,  MADISHETTY Kavitha (Univ. California, Riverside, California, USA) ,  BHAT Prasanna (Univ. California, Riverside, California, USA) ,  MOSCOU Matthew (Univ. California, Riverside, California, USA) ,  RESNIK Josh (Univ. California, Riverside, California, USA) ,  WANAMAKER Steve (Univ. California, Riverside, California, USA) ,  WANNAMAKER Steve (Univ. California, Riverside, California, USA) ,  WISE Roger P. (Iowa State Univ., Iowa, USA) ,  GRANER Andreas (Leibniz Inst. of Plant Genetics and Crop Plant Res. (IPK), Seeland OT Gatersleben, DEU) ,  STEIN Nils (Leibniz Inst. of Plant Genetics and Crop Plant Res. (IPK), Seeland OT Gatersleben, DEU) ,  ARIYADASA Ruvini (Leibniz Inst. of Plant Genetics and Crop Plant Res. (IPK), Seeland OT Gatersleben, DEU) ,  SCHULTE Daniela (Leibniz Inst. of Plant Genetics and Crop Plant Res. (IPK), Seeland OT Gatersleben, DEU) ,  POURSAREBANI Naser (Leibniz Inst. of Plant Genetics and Crop Plant Res. (IPK), Seeland OT Gatersleben, DEU) ,  ZHOU Ruonan (Leibniz Inst. of Plant Genetics and Crop Plant Res. (IPK), Seeland OT Gatersleben, DEU) ,  STEUERNAGEL Burkhard (Leibniz Inst. of Plant Genetics and Crop Plant Res. (IPK), Seeland OT Gatersleben, DEU) ,  MASCHER Martin (Leibniz Inst. of Plant Genetics and Crop Plant Res. (IPK), Seeland OT Gatersleben, DEU) ,  SCHOLZ Uwe (Leibniz Inst. of Plant Genetics and Crop Plant Res. (IPK), Seeland OT Gatersleben, DEU) ,  HIMMELBACH Axel (Leibniz Inst. of Plant Genetics and Crop Plant Res. (IPK), Seeland OT Gatersleben, DEU) ,  SCHMUTZER Thomas (Leibniz Inst. of Plant Genetics and Crop Plant Res. (IPK), Seeland OT Gatersleben, DEU) ,  MATSUMOTO Takashi (National Inst. of Agrobiological Sci., Ibaraki, JPN) ,  TANAKA Tsuyoshi (National Inst. of Agrobiological Sci., Ibaraki, JPN) ,  SATO Kazuhiro (Okayama Univ., Kurashiki, JPN) ,  SCHULMAN Alan (Univ. Helsinki, Helsinki, FIN)
資料名： Nature (London)  (Nature (London))
巻： 491  号： 7426  ページ： 711-716  発行年： 2012年11月29日 
JST資料番号： D0193B  ISSN： 0028-0836  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： オオムギ(Hordeum vulgare L.)は,世界で最も早く栽培化された最も重要な作物の1つである。オオムギは5.1ギガ塩基(Gb)という巨大な半数体ゲノムを持つ二倍体である。本論文では,統合かつ整列させた,物理的,遺伝学的および機能的な配列情報資源を示し,構築された全ゲノム中のオオムギの遺伝子空間を説明する。我々は,4.98Gbについて物理的地図を作成し,3.90Gb以上については高解像度の遺伝学的地図に位置を対応付けた。この枠組みに,大規模な全ゲノムショットガン配列アセンブリや,相補的DNAおよび詳細なRNA配列データを投影すると,79,379個の転写産物クラスターの存在が裏付けられる(この中には,ほかの植物ゲノムからの相同性により支持される「信頼性の高い」遺伝子26,159個が含まれる)。多数の選択的スプライシング,中途終止コドンおよび新規の転写活性化領域の存在は,転写後のプロセシングが重要な調節層を形成することを示唆している。多様性のあるオオムギ系統のサーベイ配列により,広域的な一塩基多型の全体像が明らかになる。我々のデータは,ゲノム情報を利用した研究および現在の作物改良の両方の基盤を提供する。Copyright Nature Publishing Group 2012

シソーラス用語： *オオムギ ,  *ゲノム ,  遺伝子地図 ,  ヌクレオチド配列 ,  RNAスプライシング ,  一塩基多型 ,  染色体地図
準シソーラス用語： *Hordeum vulgare ,  SNP

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  麦  (FC03033M)

タイトルに関連する用語 (5件)： オオムギ ,  ゲノム ,  物理 ,  遺伝学 ,  組み立て