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J-GLOBAL ID：201202223509833865   整理番号：12A0619921

LC-MSベースプロテオームに適用するための簡単なドデシル硫酸ナトリウム支援試料調製法

Simple Sodium Dodecyl Sulfate-Assisted Sample Preparation Method for LC-MS-Based Proteomics Applications

著者 (13件)： ZHOU Jian-Ying (Pacific Northwest National Lab., Washington, USA) ,  DANN Geoffrey P. (Pacific Northwest National Lab., Washington, USA) ,  SHI Tujin (Pacific Northwest National Lab., Washington, USA) ,  WANG Lu (Pacific Northwest National Lab., Washington, USA) ,  GAO Xiaoli (Pacific Northwest National Lab., Washington, USA) ,  SU Dian (Pacific Northwest National Lab., Washington, USA) ,  NICORA Carrie D. (Pacific Northwest National Lab., Washington, USA) ,  SHUKLA Anil K. (Pacific Northwest National Lab., Washington, USA) ,  MOORE Ronald J. (Pacific Northwest National Lab., Washington, USA) ,  LIU Tao (Pacific Northwest National Lab., Washington, USA) ,  CAMP David G. II (Pacific Northwest National Lab., Washington, USA) ,  SMITH Richard D. (Pacific Northwest National Lab., Washington, USA) ,  QIAN Wei-Jun (Pacific Northwest National Lab., Washington, USA)
資料名： Analytical Chemistry  (Analytical Chemistry)
巻： 84  号： 6  ページ： 2862-2867  発行年： 2012年03月20日 
JST資料番号： A0395A  ISSN： 0003-2700  CODEN： ANCHAM  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 生体物質を可溶性にするためにドデシル硫酸ナトリウムが広く用いられているが,液体クロマトグラフィー-質量分析ベースプロテオミクスでのドデシル硫酸ナトリウムの適用は逆相液体クロマトグラフィーに及ぼす影響及び大きなドデシル硫酸ナトリウム関連信号を誘導する表面活性によって制限され,さらには,高濃度ドデシル硫酸ナトリウムが酵素による蛋白質消化を妨害するなどの問題がある。本研究ではペプチドレベルのドデシル硫酸ナトリウムを除去することによって促進できるプロテオミクスのための簡単なドデシル硫酸ナトリウム-支援試料調製法を提案した。この方法は0.5%以上のドデシル硫酸ナトリウムを含む緩衝液に蛋白質を抽出し,0.07%以下のドデシル硫酸ナトリウム中で消化した後,ドデシル硫酸カリウム沈殿によってペプチド試料からドデシル硫酸ナトリウムを除去するもので,哺乳類組織と細菌試料についてのプロテオームに関して標準プロテオミクス調製法による試料について,LC-MS/MS分析によるプロテオームに相当する,あるいはそれ以上の結果を得ることができた。そしてこれらの結果はドデシル硫酸ナトリウム支援プロトコルが実際的であり,広く適用可能なプロテオミクス試料処理法であることを示唆した。

シソーラス用語： *プロテオーム ,  *LC-MS分析 ,  *タンデム質量分析 ,  *試料調製 ,  *陰イオン界面活性剤 ,  可溶化 ,  生体試料 ,  逆相 ,  界面活性 ,  タンパク質分解 ,  溶媒抽出 ,  カリウム化合物 ,  沈殿 ,  SDS-PAGE ,  Vibrionaceae ,  データ解析 ,  回収率 ,  哺乳類 ,  プロテオミクス ,  脂肪族アルコール ,  無機酸エステル
準シソーラス用語： *LC-MS/MS分析 ,  Shewanella oneidensis ,  細胞溶解 ,  除去効率 ,  表面活性

分類 (3件)： 生物科学研究法一般  (EA03010K) ,  各種分析法一般  (CC08010X) ,  その他の洗浄剤  (YG02040W)

物質索引 (1件)： ドデシル硫酸ナトリウム

タイトルに関連する用語 (5件)： LC-MS ,  プロテオーム ,  ドデシル硫酸ナトリウム ,  支援 ,  試料調製