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J-GLOBAL ID:201202224544743301   整理番号:12A1500449

時間分解多段動的系をモデリングするための数値フレームワーク

Numerical framework to model temporally resolved multi-stage dynamic systems
著者 (7件):
資料名:
巻: 108  号:ページ: 750-759  発行年: 2012年11月 
JST資料番号: D0213C  ISSN: 0169-2607  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: アイルランド (IRL)  言語: 英語 (EN)
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ステロイドホルモンの信号伝達の数値モデリングは,複数事象の空間時間協調を含む興味深い問題である。細胞質におけるリガンド結合が,分子群の乖離および/あるいは会合を引き起こし,これによりその後の細胞核のDNA結合と転写活性を制御する。総合的な多段モデルを開発するためには,転写結果だけでなく,中間の蛋白質複合体をフォローすることが必要である。このためLabVIEWの中に,非線形微分方程式群として複雑な生化学プロセスを模擬するためのソフトウェアツールキットを開発した。このツールキットは,ビジュアルで,高度にモジュール化されており,残りのLabVIEWと粗結合し,スケーラブルで,拡張可能である。このツールキットを用いて,生化学モデルを開発,検証でき,既存の実験データからモデルパラメータを推定できる。細胞内のステロイドホルモン応答のシミュレーションのためのツールキットの応用を示し,他の生物学および化学系に対するこのツールキットの使い方も示した。ここに示したソフトウェアモジュールは,単独で使えるだけでなく,データ収集や分析応用の中に組み込むことができる。Copyright 2012 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.
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分類 (1件):
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分子・遺伝情報処理 

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