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J-GLOBAL ID：201202225450010366   整理番号：12A1773368

ショットガンプロテオミクスのための低分解能タンデム質量スペクトルにおける新たな質量測定誤差補正

De Novo Correction of Mass Measurement Error in Low Resolution Tandem MS Spectra for Shotgun Proteomics

著者 (6件)： EGERTSON Jarrett D. (Univ. of Washington, Dep. of Genome Sciences, 98195, Seattle, WA, USA) ,  ENG Jimmy K. (Univ. of Washington, Dep. of Genome Sciences, 98195, Seattle, WA, USA) ,  BEREMAN Michael S. (Univ. of Washington, Dep. of Genome Sciences, 98195, Seattle, WA, USA) ,  HSIEH Edward J. (Univ. of Washington, Dep. of Genome Sciences, 98195, Seattle, WA, USA) ,  MERRIHEW Gennifer E. (Univ. of Washington, Dep. of Genome Sciences, 98195, Seattle, WA, USA) ,  MACCOSS Michael J. (Univ. of Washington, Dep. of Genome Sciences, 98195, Seattle, WA, USA)
資料名： Journal of the American Society for Mass Spectrometry  (Journal of the American Society for Mass Spectrometry)
巻： 23  号： 12  ページ： 2075-2082  発行年： 2012年12月 
JST資料番号： W0174A  ISSN： 1044-0305  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ペプチドの低分解能質量スペクトルにキャリブレーションを行うために設計したアルゴリズムを報告する。著者らのアルゴリズムは,FineTuneという名称のプログラム中に実装されたものであって,質量測定の系統誤差を1分以内で補正し,その際に質量スペクトルそのもの以外何も入力する必要がない。LTQ-Veloにより取得した一連のスペクトルに対する質量測定正確さはキャリブレーションを行うことにより-0.1776±0.0010m/zから0.0078±0.0006m/z(平均値±95%信頼区間)へと20倍改善された。m/z範囲全体に亘る質量測定正確さの非線形変動を補正することにより,質量測定精度が向上した。Copyright 2012 American Society for Mass Spectrometry Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： *プロテオミクス ,  分解能 ,  *計測 ,  誤り訂正 ,  アルゴリズム ,  *タンデム質量分析
準シソーラス用語： *ショットガンプロテオミクス ,  低分解能 ,  *質量測定

分類 (2件)： 有機化合物の物理分析  (CC03034A) ,  蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N)

タイトルに関連する用語 (6件)： ショットガンプロテオミクス ,  低分解能 ,  タンデム ,  質量スペクトル ,  質量測定 ,  誤差補正