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J-GLOBAL ID：201202228086575491   整理番号：12A1398400

ショットガンプロテオミクスによるデータベース検索空間低減における予測2-D液体クロマトグラフィーの限界:計算機利用研究

Limitation of predictive 2-D liquid chromatography in reducing the database search space in shotgun proteomics: In silico studies

著者 (4件)： MOSKOVETS Eugene (MassTech Inc., Maryland, USA) ,  GOLOBORODKO Anton A. (Inst. for Energy Problems of Chemical Physics, Moscow, RUS) ,  GORSHKOV Alexander V. (N. N. Semenov’s Inst. of Chemical Physics, Moscow, RUS) ,  GORSHKOV Mikhail V. (Inst. for Energy Problems of Chemical Physics, Moscow, RUS)
資料名： Journal of Separation Science  (Journal of Separation Science)
巻： 35  号： 14  ページ： 1771-1778  発行年： 2012年07月 
JST資料番号： A0139B  ISSN： 1615-9306  CODEN： JSSCCJ  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 親水性相互作用順相と逆相を組み合わせた二次元液体クロマトグラフィー(2-D LC)による複合ペプチド混合物の同時分析を研究した。2-D LC直交性を最適化し,経験モデル予測への実験的ペプチド保持時間のマッチングによってデータベース検索空間の大幅な低減を実現した。異なる分離条件(pH2及び10)でC18逆相及びTSKゲルアミド-80順相によって分離したトリプシンペプチドの保持時間を計算することで,分析ペプチドの質量範囲を大幅に狭めることができた。これは固定相における保持係数の高い相関によるものと考察した。

シソーラス用語： *液体クロマトグラフィー ,  *二次元 ,  親水性 ,  逆相 ,  *ペプチド ,  *計算機利用 ,  保持時間 ,  直交性 ,  最適化 ,  データベース ,  予測技法 ,  同時分析 ,  マッチング
準シソーラス用語： 親水性相互作用液体クロマトグラフィー

分類 (2件)： クロマトグラフィー,電気泳動  (CC01050S) ,  蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N)

タイトルに関連する用語 (7件)： ショットガンプロテオミクス ,  データベース検索 ,  予測 ,  液体クロマトグラフィー ,  限界 ,  計算機利用 ,  研究